More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2431 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  100 
 
 
275 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  64.36 
 
 
272 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  61.9 
 
 
277 aa  334  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  61.68 
 
 
274 aa  330  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  53.79 
 
 
274 aa  278  5e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  54.21 
 
 
279 aa  268  7e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  41.16 
 
 
278 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  40.85 
 
 
283 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  42.55 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 
287 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  43.37 
 
 
276 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  39.72 
 
 
282 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 
278 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  38.65 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  40.73 
 
 
278 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 
278 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  38.06 
 
 
280 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 
278 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 
279 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 
278 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  36.49 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  37.24 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  37.93 
 
 
287 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  36.81 
 
 
288 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 
280 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 
295 aa  169  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  36.68 
 
 
286 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  37.15 
 
 
288 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 
288 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  37.14 
 
 
272 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  37.89 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 
293 aa  166  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 
289 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  36.01 
 
 
282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  39.85 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0671  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 
309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00498295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  38.08 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  36.77 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  37.89 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  40.93 
 
 
279 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 
281 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  38.69 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 
295 aa  162  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 
295 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 
289 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 
280 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 
289 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 
289 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 
289 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 
283 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 
289 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 
289 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 
286 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 
277 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 
289 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  35.37 
 
 
334 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 
257 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 
309 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 
309 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  37.46 
 
 
304 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 
278 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 
368 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 
387 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 
309 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  35.76 
 
 
292 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  35 
 
 
277 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 
284 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 
287 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
279 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 
281 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 
266 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 
308 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 
279 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 
284 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 
281 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 
284 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  37.98 
 
 
285 aa  158  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  35.13 
 
 
260 aa  158  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  35.76 
 
 
292 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  35.05 
 
 
288 aa  158  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 
292 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 
277 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 
288 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 
288 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 
288 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 
288 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 
288 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 
288 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  36.81 
 
 
286 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 
259 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  36.17 
 
 
278 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 
277 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 
256 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 
276 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>