More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2422 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  100 
 
 
722 aa  1472    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
547 aa  405  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  40.16 
 
 
654 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  40.73 
 
 
682 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  39.5 
 
 
749 aa  398  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  37.82 
 
 
791 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  40.2 
 
 
609 aa  392  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  41.49 
 
 
549 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  39.44 
 
 
556 aa  363  8e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  37.32 
 
 
640 aa  361  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  40.12 
 
 
628 aa  361  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
545 aa  355  1e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  38.57 
 
 
542 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
551 aa  351  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  37.78 
 
 
558 aa  346  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  37.4 
 
 
549 aa  346  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  36.54 
 
 
591 aa  339  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  34.76 
 
 
797 aa  332  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.4 
 
 
583 aa  318  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  37.95 
 
 
847 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  37.62 
 
 
1335 aa  309  9e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  38.58 
 
 
770 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  36.87 
 
 
510 aa  308  3e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  36.64 
 
 
831 aa  306  8.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  37.31 
 
 
692 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  37.41 
 
 
1319 aa  304  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  38.05 
 
 
1255 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  34.73 
 
 
991 aa  299  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  34 
 
 
519 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
671 aa  276  8e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  31.47 
 
 
604 aa  267  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  35.91 
 
 
617 aa  261  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  35 
 
 
612 aa  260  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  33.86 
 
 
513 aa  254  5.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  32.88 
 
 
512 aa  251  4e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
622 aa  249  9e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  32.83 
 
 
543 aa  248  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  31.65 
 
 
547 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  31.65 
 
 
549 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  37.23 
 
 
618 aa  243  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  31.76 
 
 
557 aa  243  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  35.25 
 
 
610 aa  243  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  31.17 
 
 
546 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  30.65 
 
 
546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.46 
 
 
491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.89 
 
 
492 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  32.89 
 
 
492 aa  240  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  30.84 
 
 
546 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  29.94 
 
 
557 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  31.55 
 
 
546 aa  237  6e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  31.35 
 
 
620 aa  236  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.08 
 
 
489 aa  233  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  29.37 
 
 
557 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  29.79 
 
 
559 aa  225  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  29.36 
 
 
577 aa  197  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  27.45 
 
 
572 aa  192  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.08 
 
 
473 aa  190  8e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  29.73 
 
 
476 aa  186  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  32.95 
 
 
548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  32.95 
 
 
552 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  32.95 
 
 
552 aa  180  7e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  29.98 
 
 
515 aa  177  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  31.38 
 
 
311 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  30.56 
 
 
504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  29.46 
 
 
485 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  29.02 
 
 
500 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  29.46 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  29.2 
 
 
482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  30.02 
 
 
480 aa  164  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  30.33 
 
 
544 aa  163  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
483 aa  162  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  28.69 
 
 
508 aa  161  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  29.73 
 
 
484 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.67 
 
 
492 aa  160  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  31.1 
 
 
482 aa  160  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  28.21 
 
 
491 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  29.92 
 
 
482 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  28.12 
 
 
491 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.36 
 
 
438 aa  157  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  28.94 
 
 
489 aa  157  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  31.01 
 
 
477 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  28.68 
 
 
488 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  29.81 
 
 
490 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  30.35 
 
 
482 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  35.59 
 
 
454 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  30.41 
 
 
488 aa  156  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.07 
 
 
428 aa  155  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.07 
 
 
428 aa  155  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.07 
 
 
428 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  32.4 
 
 
444 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  32.4 
 
 
444 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  29.54 
 
 
467 aa  154  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  28.94 
 
 
433 aa  154  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  31.37 
 
 
438 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  27.87 
 
 
498 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>