260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2419 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



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Replicon accession

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% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  100 
 
 
684 aa  1385    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.71 
 
 
1667 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.74 
 
 
752 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  29.83 
 
 
1236 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  30.78 
 
 
1862 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  28.63 
 
 
941 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34.83 
 
 
1667 aa  151  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.6 
 
 
3295 aa  142  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  45.29 
 
 
1094 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  43.1 
 
 
791 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  43.96 
 
 
669 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  45.03 
 
 
2272 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  43.01 
 
 
735 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  41.11 
 
 
551 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.59 
 
 
679 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  44.51 
 
 
581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  42.94 
 
 
2036 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  43.33 
 
 
1882 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  41.11 
 
 
1120 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  42.86 
 
 
561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  42.22 
 
 
1682 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  43.85 
 
 
845 aa  131  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  42.86 
 
 
615 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  42.22 
 
 
1300 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  39.88 
 
 
859 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  42.22 
 
 
547 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  44.79 
 
 
910 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  43.98 
 
 
2554 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  41.81 
 
 
560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  43.02 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  41.75 
 
 
1241 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  43.33 
 
 
1969 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  41.26 
 
 
2000 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  44.39 
 
 
1732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  44.51 
 
 
685 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  42.94 
 
 
658 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  43.17 
 
 
2122 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  30.18 
 
 
500 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  40.56 
 
 
713 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  43.96 
 
 
1361 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  40.29 
 
 
1842 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  38.53 
 
 
575 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.49 
 
 
823 aa  126  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  46.54 
 
 
519 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  41.67 
 
 
978 aa  125  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  39.49 
 
 
675 aa  124  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  42.25 
 
 
963 aa  124  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  39.64 
 
 
644 aa  124  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  28.8 
 
 
530 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  40.1 
 
 
930 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.53 
 
 
802 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 
786 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  40.98 
 
 
1528 aa  120  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  44.12 
 
 
870 aa  120  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  42.55 
 
 
719 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  41.49 
 
 
930 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  39.35 
 
 
996 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.49 
 
 
840 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.44 
 
 
838 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  40.59 
 
 
528 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  41.85 
 
 
819 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  40.72 
 
 
769 aa  112  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  42.59 
 
 
1328 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  42.2 
 
 
816 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  42.77 
 
 
460 aa  111  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  41.85 
 
 
777 aa  111  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  36.65 
 
 
1282 aa  111  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  41.86 
 
 
861 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 
1356 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  38.58 
 
 
1292 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  36.55 
 
 
400 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  38.92 
 
 
439 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  37.91 
 
 
1931 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  37.43 
 
 
1231 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  41.82 
 
 
940 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  38.6 
 
 
958 aa  101  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  30.83 
 
 
2176 aa  101  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  37.43 
 
 
869 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  38.67 
 
 
952 aa  98.2  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  39.78 
 
 
1387 aa  97.4  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  40.96 
 
 
2552 aa  97.4  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  32.03 
 
 
848 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  38.92 
 
 
938 aa  97.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  36.54 
 
 
1311 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  37.11 
 
 
971 aa  95.1  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40.13 
 
 
1095 aa  94.7  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  37.43 
 
 
1189 aa  94.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  38.32 
 
 
1531 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  39.64 
 
 
960 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  25.23 
 
 
1606 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  38.89 
 
 
929 aa  85.5  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  34.86 
 
 
821 aa  84.7  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.05 
 
 
1783 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  32.76 
 
 
1814 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  32.57 
 
 
1620 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
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NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  29.55 
 
 
1380 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  35.93 
 
 
819 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
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NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  37.3 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_1164  PKD  35.53 
 
 
1011 aa  80.9  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  35.8 
 
 
918 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
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