More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2323 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 549 aa  1110    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  46.86 
 
 		 569 aa  501  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  29.93 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  32.62 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  27.53 
 
 		 542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  28.22 
 
 		 548 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 544 aa  174  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  25.53 
 
 		 567 aa  159  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  26.37 
 
 		 564 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  28.78 
 
 		 541 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  26.64 
 
 		 562 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  25.71 
 
 		 568 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  25.49 
 
 		 614 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  25.97 
 
 		 567 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  26.6 
 
 		 576 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  23.43 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  31.96 
 
 		 346 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  32.56 
 
 		 225 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 347 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  30.91 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.84 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  29.8 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  24.39 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  31.08 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  33.12 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  30.18 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  30.63 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.25 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  25.3 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  27.2 
 
 		 384 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  31.09 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  34.62 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  32.86 
 
 		 347 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 		 350 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  24.9 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  24.9 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.31 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  28.25 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  28.76 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.27 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  32.39 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  27.43 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  29.71 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  23.8 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.4 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  28.84 
 
 		 331 aa  72  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  29.29 
 
 		 334 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  28.33 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  28.33 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  27.93 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28.33 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  25.96 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.09 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  34.19 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 341 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  27.43 
 
 		 352 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  27.47 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  23.93 
 
 		 457 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  36.19 
 
 		 206 aa  67  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  26.94 
 
 		 335 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  28.07 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  31.87 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  27.91 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  23.93 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  23.7 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  24.52 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  27.91 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  23.34 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  34.82 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  32.62 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  23.17 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  26.67 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  27.91 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.41 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  25.35 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  23.87 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  31.68 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  31.68 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  23.7 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  28.25 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  24.6 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  31.68 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  31.68 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  31.68 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.92 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  23.23 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  25.35 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  35.83 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>