30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2317 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
379 aa  740    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  48.28 
 
 
432 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  35.26 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  38.74 
 
 
435 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  34.83 
 
 
600 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.74 
 
 
1085 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  39.19 
 
 
561 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  43.84 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  33.88 
 
 
460 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  35.44 
 
 
963 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  35.65 
 
 
1096 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  29.11 
 
 
613 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  30.17 
 
 
219 aa  52.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  34.94 
 
 
684 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  36.96 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  25.16 
 
 
436 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  33.08 
 
 
311 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  38.1 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  45.83 
 
 
497 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  35 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  34.85 
 
 
930 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  31.58 
 
 
326 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  30.67 
 
 
271 aa  46.6  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  29.41 
 
 
727 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  35.21 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0575  PEGA domain-containing protein  25.26 
 
 
269 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.416846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  29.67 
 
 
465 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0992  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
774 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  33.78 
 
 
211 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0261  PEGA domain-containing protein  27.91 
 
 
266 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00732448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>