90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2311 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  95.21 
 
 		 334 aa  634    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  100 
 
 		 334 aa  678    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  93.73 
 
 		 337 aa  620  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  93.47 
 
 		 337 aa  614  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  89.61 
 
 		 340 aa  594  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  84.27 
 
 		 337 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  84.87 
 
 		 337 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  83.08 
 
 		 337 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  76.64 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  76.64 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  76.64 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  76.64 
 
 		 339 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  71.77 
 
 		 334 aa  474  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  75.99 
 
 		 339 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  75.99 
 
 		 339 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  75.66 
 
 		 339 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  66.88 
 
 		 312 aa  420  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.85 
 
 		 321 aa  393  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  60 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  60 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  61.74 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  62.03 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.46 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  60.47 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  60.07 
 
 		 321 aa  362  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.95 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  57.59 
 
 		 322 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  55.73 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  55.13 
 
 		 323 aa  342  5e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  58.13 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  58.13 
 
 		 327 aa  338  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  55.41 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  56.23 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  56.85 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  54.49 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  55.63 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  55.38 
 
 		 323 aa  332  4e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  57.19 
 
 		 323 aa  332  8e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.61 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  56.85 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  56.4 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  50.67 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  51.54 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  50.66 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  56.79 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  47.8 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  47.46 
 
 		 333 aa  282  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  47.12 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  46.78 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  49.38 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.14 
 
 		 301 aa  272  6e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  43.05 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.71 
 
 		 302 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.92 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.16 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.96 
 
 		 307 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.75 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.21 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.66 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  36.16 
 
 		 318 aa  212  9e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.27 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.41 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  39.72 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  38.57 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.41 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.25 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  38.67 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.16 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  36.42 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  33.22 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  32.18 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  30.23 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.06 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  28.39 
 
 		 447 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.16 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  30.29 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.19 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.91 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.28 
 
 		 279 aa  90.5  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.94 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  25.52 
 
 		 601 aa  86.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  26.67 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  26.67 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  25.51 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  33.91 
 
 		 713 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  28.57 
 
 		 691 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  22.73 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2242  Transcription factor TFIIB cyclin-related  35.62 
 
 		 103 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0402  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.67 
 
 		 102 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.9 
 
 		 102 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>