More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2308 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2308  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0470  hydrogenase accessory protein HypB  81.86 
 
 		 215 aa  367  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  78.5 
 
 		 215 aa  350  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.734472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  74.42 
 
 		 215 aa  340  7e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1515  hypothetical protein  70.23 
 
 		 215 aa  327  6e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1150  hydrogenase accessory protein HypB  48.6 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.922491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0055  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1020  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0768  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  44.6 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0833  hydrogenase accessory protein HypB  46.26 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2335  hydrogenase accessory protein HypB  51.85 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  42.31 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  42.79 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  41.9 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  42.11 
 
 		 326 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  40.48 
 
 		 292 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  41.43 
 
 		 289 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  43.27 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  43.27 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  39.7 
 
 		 225 aa  157  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  39.52 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  36.14 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  40.1 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  40.89 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  41.35 
 
 		 301 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  40.48 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  38.1 
 
 		 253 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  41.35 
 
 		 321 aa  154  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  39.3 
 
 		 286 aa  154  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  38.1 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  40.87 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  37.56 
 
 		 217 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  40.49 
 
 		 312 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  37.98 
 
 		 352 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 281 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  38.97 
 
 		 281 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2548  hydrogenase accessory protein HypB  38.46 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0731217  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  39.41 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  38.31 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  38.35 
 
 		 264 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  39.02 
 
 		 277 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  39.58 
 
 		 285 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  40.48 
 
 		 300 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  38.24 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  39.23 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  36.54 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  35.12 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  37.95 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  39.18 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  34.29 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  38.46 
 
 		 270 aa  148  6e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  39.72 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 322 aa  148  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  36.63 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  38.57 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  38.42 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  41.71 
 
 		 283 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 268 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  37.88 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  36.23 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  36.87 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  38.57 
 
 		 306 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  36.63 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  38.1 
 
 		 264 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  35.29 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  39.27 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  34.95 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  37.74 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  36.27 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  34.3 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  37.88 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  40.93 
 
 		 394 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.62 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  40.3 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.62 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  37.5 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  39.39 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.62 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  37.44 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.62 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  33.82 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.42 
 
 		 303 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  37.98 
 
 		 269 aa  142  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  41.84 
 
 		 313 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  40.38 
 
 		 318 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 		 407 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  33.82 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  38.19 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  37.9 
 
 		 328 aa  141  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  35.24 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  34.48 
 
 		 271 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  38.94 
 
 		 315 aa  141  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  39.9 
 
 		 282 aa  141  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  37.02 
 
 		 290 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.02 
 
 		 290 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>