32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2295 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  100 
 
 		 143 aa  283  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  62.1 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  61.29 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  55.38 
 
 		 132 aa  156  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  60.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  47.58 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  47.54 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  47.93 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  41.13 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  39.52 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  42.86 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  40.34 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  36.51 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  36.8 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  41.03 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  37.3 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2296  hypothetical protein  91.11 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  40.65 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  40.17 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  39.84 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  39.82 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  34.29 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  40.82 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  39.8 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  36.89 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  37.29 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  33.58 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  37.7 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  36.44 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  35.71 
 
 		 237 aa  52  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  34.69 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  26.92 
 
 		 245 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>