More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2231 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  62.57 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  59.36 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  52.13 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  37.36 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  33 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  39.18 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 207 aa  94.7  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  40.98 
 
 		 131 aa  85.5  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.81 
 
 		 145 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  40.87 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  36.8 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  32.86 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  34.13 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 615 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  32.81 
 
 		 586 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 620 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  33.09 
 
 		 615 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  32.35 
 
 		 615 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 620 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 620 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  35.16 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  28.93 
 
 		 615 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 		 688 aa  75.1  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.59 
 
 		 613 aa  75.1  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 		 478 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 620 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.44 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  29.71 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  32.56 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  26.89 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  35.35 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.61 
 
 		 688 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  28.83 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  34.75 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 		 600 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  26.32 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.2 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.77 
 
 		 589 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  30.88 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  29.52 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  31.17 
 
 		 615 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 		 615 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.36 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  35.09 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.61 
 
 		 603 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  34.68 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  36.44 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  37.29 
 
 		 136 aa  72  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  30.66 
 
 		 139 aa  72  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  30.88 
 
 		 615 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.88 
 
 		 615 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  37.7 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.61 
 
 		 603 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  34.11 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.17 
 
 		 606 aa  71.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  34.13 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  36 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  33.91 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  31.36 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  32.35 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  31.34 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  31.9 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  45.28 
 
 		 120 aa  70.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  32.85 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  30.83 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.77 
 
 		 603 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  34.48 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  31.76 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  32.79 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  32.76 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.17 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  26.43 
 
 		 613 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  34 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  30 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  34.29 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  36.11 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  29.13 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.58 
 
 		 644 aa  68.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  33.62 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  28.31 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  29.58 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  35 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>