115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2201 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 329 aa  681    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  62.58 
 
 		 327 aa  435  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  62.96 
 
 		 565 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  61.61 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  61.32 
 
 		 321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  54.43 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  52.02 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  48.08 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  47.92 
 
 		 351 aa  285  5e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  46.79 
 
 		 380 aa  285  9e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  45.65 
 
 		 860 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.41 
 
 		 863 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  46.03 
 
 		 387 aa  282  5.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  46.25 
 
 		 881 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  46.08 
 
 		 857 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46.2 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  44.58 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46.2 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  44.24 
 
 		 867 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  46.01 
 
 		 820 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  44.63 
 
 		 368 aa  278  6e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  44.74 
 
 		 836 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  45.2 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  44.62 
 
 		 856 aa  276  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  45.24 
 
 		 871 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  45.17 
 
 		 352 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  43.69 
 
 		 859 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  42.81 
 
 		 859 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  42.81 
 
 		 859 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  42.81 
 
 		 859 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  44.89 
 
 		 859 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  43.98 
 
 		 838 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  45.62 
 
 		 852 aa  272  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  45.12 
 
 		 841 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.74 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  43.73 
 
 		 859 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  43.12 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  44.98 
 
 		 826 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  45.2 
 
 		 800 aa  265  8e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  43.62 
 
 		 811 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.49 
 
 		 872 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  43.73 
 
 		 792 aa  262  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  42.09 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  46.46 
 
 		 380 aa  258  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  45.05 
 
 		 884 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  43.03 
 
 		 842 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.95 
 
 		 875 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  45.76 
 
 		 779 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  43.81 
 
 		 430 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40.83 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  44.66 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  43.2 
 
 		 944 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  42.9 
 
 		 899 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  41.69 
 
 		 841 aa  233  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 		 390 aa  229  4e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.21 
 
 		 737 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  40.88 
 
 		 757 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.36 
 
 		 737 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.06 
 
 		 741 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  42.64 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  43.41 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  39.39 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  39.88 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  37.65 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  39.48 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  37.13 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  26.48 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  28.91 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  22.3 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  23.81 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  21.96 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 375 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 361 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  24.74 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  23.35 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  27.62 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  22.91 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 364 aa  47.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  22.94 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  23.36 
 
 		 361 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  23.11 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  22.47 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  23.56 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  25.91 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>