More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2166 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  100 
 
 		 365 aa  748    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  69.15 
 
 		 363 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  67.67 
 
 		 365 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  61.39 
 
 		 365 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  59.89 
 
 		 369 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  47.63 
 
 		 379 aa  349  5e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  47.06 
 
 		 395 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  48.11 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  40.58 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  40.58 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  44.94 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  39.79 
 
 		 384 aa  269  5e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  44.84 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  44.44 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  41.22 
 
 		 384 aa  263  4e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  42.09 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  39.95 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  45.32 
 
 		 355 aa  252  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.75 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.49 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.55 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.65 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.33 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.55 
 
 		 478 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.95 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.05 
 
 		 514 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.4 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.23 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.1 
 
 		 498 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.64 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.63 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.68 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02100  histidine decarboxylase  26.86 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  34.22 
 
 		 572 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.88 
 
 		 494 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.99 
 
 		 500 aa  119  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  31.05 
 
 		 546 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  30.82 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87778  dihydrosphingosine-1-phosphate lyase  30.66 
 
 		 603 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  31.2 
 
 		 473 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  34.67 
 
 		 473 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  31.21 
 
 		 483 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13469  glutamate decarboxylase gadB  30.72 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.294595  hitchhiker  0.000990947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.3 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  27.94 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1145  glutamate decarboxylase  30.23 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1172  glutamate decarboxylase  30.23 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615591  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.73 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1162  glutamate decarboxylase  30.23 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.824661 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  31.2 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1139  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  31.2 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.428342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2912  sphingosine-1-phosphate lyase  31.2 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0389716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1483  glutamate decarboxylase  30.47 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2918  sphingosine-1-phosphate lyase  29.81 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1143  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  29.49 
 
 		 473 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2761  sphingosine-1-phosphate lyase  29.49 
 
 		 498 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3467  glutamate decarboxylase  28.08 
 
 		 457 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.43113  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2953  glutamate decarboxylase  30.5 
 
 		 464 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5339  glutamate decarboxylase  29.71 
 
 		 468 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4935  glutamate decarboxylase  27.72 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2128  hypothetical protein  27.59 
 
 		 605 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2102  hypothetical protein  27.41 
 
 		 605 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1637  histidine decarboxylase  26.79 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3997  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.66 
 
 		 516 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167245  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1640  glutamate decarboxylase  28.17 
 
 		 470 aa  99.8  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0045  glutamate decarboxylase  27.3 
 
 		 468 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07278  glutamate decarboxylase (Eurofung)  26.28 
 
 		 521 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8660  glutamate decarboxylase  30.12 
 
 		 463 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0181  glutamate decarboxylase  30.58 
 
 		 466 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4739  glutamate decarboxylase  27.66 
 
 		 464 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.34 
 
 		 500 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03063  glutamate decarboxylase  28.01 
 
 		 464 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  27.78 
 
 		 532 aa  97.1  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2315  glutamate decarboxylase  26.3 
 
 		 464 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  28.23 
 
 		 472 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1197  glutamate decarboxylase beta  28.37 
 
 		 464 aa  96.3  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2691  glutamate decarboxylase  28.22 
 
 		 489 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0236488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3826  glutamate decarboxylase  28.76 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3028  histidine decarboxylase  26.99 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.726503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.27 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.76 
 
 		 461 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3771  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.98 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0013231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.38 
 
 		 549 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0149  glutamate decarboxylase  26.8 
 
 		 496 aa  93.2  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.283505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2029  glutamate decarboxylase  26.16 
 
 		 466 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  27.14 
 
 		 515 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6904  glutamate decarboxylase  30.22 
 
 		 473 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2341  glutamate decarboxylase  29.04 
 
 		 466 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0367356  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0551  glutamate decarboxylase  27.54 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1646  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.66 
 
 		 531 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.360042  hitchhiker  0.00112571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.05 
 
 		 549 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.52 
 
 		 560 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.43 
 
 		 549 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4374  glutamate decarboxylase  29.01 
 
 		 466 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  32.33 
 
 		 548 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.43 
 
 		 549 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03700  glutamate decarboxylase, putative  25.94 
 
 		 557 aa  87.8  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03700  glutamate decarboxylase, putative  25.94 
 
 		 557 aa  87.8  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  23.72 
 
 		 461 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18041  glutamate decarboxylase  26.52 
 
 		 479 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.171895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>