More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2100 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  57.69 
 
 
234 aa  280  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  52.59 
 
 
233 aa  240  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  48.89 
 
 
226 aa  230  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  45.69 
 
 
232 aa  228  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  35.56 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  35.09 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  33.19 
 
 
222 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1809  SPP-like hydrolase  37.55 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.752467  normal  0.527936 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1156  SPP-like hydrolase  37 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2968  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.86 
 
 
228 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  34.47 
 
 
227 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0938  SPP-like hydrolase  33.77 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  33.93 
 
 
240 aa  92  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  28 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  33.48 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  32 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  26.32 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.49 
 
 
278 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  29.82 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  27.45 
 
 
222 aa  77  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000113582  hitchhiker  0.0000579549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  25.86 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  25.1 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.92 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  25.1 
 
 
271 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  27.48 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  24.9 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  24.33 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  24.33 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  25 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0866  SPP-like hydrolase  33.04 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  25 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  27.41 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  25.19 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  26.05 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  26.82 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  24.34 
 
 
281 aa  68.6  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  26.92 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  23.19 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  24.62 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.63 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  26.42 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  24.19 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  26.09 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  29.22 
 
 
554 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  29.22 
 
 
554 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  23.13 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  23.51 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  39.62 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  20 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  24.23 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  20 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 
269 aa  63.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  25.46 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  27.11 
 
 
292 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  22.1 
 
 
279 aa  62.8  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5196  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.76 
 
 
278 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.27 
 
 
275 aa  62.4  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  28.82 
 
 
227 aa  62.4  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  23.44 
 
 
268 aa  62.4  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 
272 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  25.83 
 
 
265 aa  62  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  22.48 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  24.81 
 
 
266 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.04 
 
 
265 aa  62  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  24.24 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  27.46 
 
 
273 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  24.9 
 
 
266 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.59 
 
 
261 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  24.1 
 
 
280 aa  61.6  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  24.9 
 
 
266 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  25.97 
 
 
269 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  23.58 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  24.9 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  20.63 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  26.77 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  22.73 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  25.32 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  25.58 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.93 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  25.58 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  25.58 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  25.58 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  28.02 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  24.9 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  20.8 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  24.05 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  20.63 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  25.94 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  36.84 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  24.9 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  25.58 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  24.9 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  36.84 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>