More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2099 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 325 aa  665    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  80.12 
 
 		 327 aa  550  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  75.08 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  72.17 
 
 		 329 aa  501  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  73.52 
 
 		 324 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  65.2 
 
 		 325 aa  424  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  63.86 
 
 		 325 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  57.4 
 
 		 343 aa  404  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  57.4 
 
 		 343 aa  403  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  57.35 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  56.8 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  59.49 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  55.13 
 
 		 349 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  62.89 
 
 		 322 aa  391  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  50.47 
 
 		 332 aa  325  9e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  50.79 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  50.79 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  50.16 
 
 		 330 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  46.84 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  46.84 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  47.96 
 
 		 358 aa  309  4e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  50.46 
 
 		 322 aa  308  8e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  50.61 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  51.53 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  50.15 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  50.46 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  47.8 
 
 		 358 aa  297  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  47.52 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  40 
 
 		 658 aa  226  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  39.56 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  38.44 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  40.13 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  39.61 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  36.08 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  38.97 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  36.31 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  35.04 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  29.66 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  31.08 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  29.19 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  27.35 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  27.38 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  31.78 
 
 		 227 aa  94  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  29.61 
 
 		 227 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  27.78 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  30.58 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  25.9 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  31.91 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  30.17 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  27.76 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  29.46 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  24.63 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  26.07 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  29.83 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  28.49 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  27.43 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  30.32 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  28.69 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  28.25 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  27.57 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  25.45 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  28.3 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  29.22 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  25.6 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  25.74 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  26.17 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  25.74 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  25 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  26.15 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  29.55 
 
 		 541 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  23.58 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  24.31 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  25.6 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  26.41 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  26.92 
 
 		 358 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  23.11 
 
 		 376 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  24.19 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  24.76 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  24.76 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  26.96 
 
 		 365 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  25.6 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  25.47 
 
 		 363 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  25 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  24.02 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  26.61 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  43.75 
 
 		 236 aa  52.8  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  24.52 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  26.46 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  27.05 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  24 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  25 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  25.33 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  24.88 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  25.23 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  25.33 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  24.15 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  26.09 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  23.67 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>