162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2042 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  100 
 
 
370 aa  758    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  60.22 
 
 
361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  52.23 
 
 
369 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  39.68 
 
 
436 aa  238  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  38.78 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.3 
 
 
484 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.3 
 
 
392 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.66 
 
 
380 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.43 
 
 
406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  37.47 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.56 
 
 
383 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.99 
 
 
472 aa  203  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.04 
 
 
383 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  38.36 
 
 
309 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.58 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.95 
 
 
371 aa  199  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.77 
 
 
383 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  37.12 
 
 
335 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  39.43 
 
 
392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.71 
 
 
416 aa  196  5.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  37.37 
 
 
392 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.65 
 
 
376 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.01 
 
 
390 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.97 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.07 
 
 
474 aa  189  7e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.51 
 
 
407 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.98 
 
 
389 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.71 
 
 
405 aa  186  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.42 
 
 
407 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.42 
 
 
407 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.11 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.93 
 
 
398 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.18 
 
 
422 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  37.77 
 
 
395 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.79 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.43 
 
 
400 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.78 
 
 
402 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.86 
 
 
381 aa  178  1e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.17 
 
 
385 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  35.39 
 
 
407 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.75 
 
 
392 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 
484 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.61 
 
 
493 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.08 
 
 
413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.82 
 
 
392 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.05 
 
 
482 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.23 
 
 
482 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.23 
 
 
482 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.97 
 
 
482 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.79 
 
 
482 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.97 
 
 
482 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.97 
 
 
482 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  30.97 
 
 
482 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.97 
 
 
482 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.42 
 
 
473 aa  170  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.32 
 
 
404 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.64 
 
 
483 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.39 
 
 
475 aa  169  7e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.88 
 
 
388 aa  169  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.18 
 
 
429 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.09 
 
 
484 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.37 
 
 
401 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.9 
 
 
391 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.96 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.96 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.96 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.96 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.96 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.15 
 
 
482 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.33 
 
 
398 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
484 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
484 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.79 
 
 
484 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.64 
 
 
483 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.22 
 
 
482 aa  162  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.4 
 
 
482 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.04 
 
 
482 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.8 
 
 
420 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.1 
 
 
484 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.77 
 
 
500 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.1 
 
 
484 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0819  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.34 
 
 
394 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.64 
 
 
484 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.1 
 
 
484 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.1 
 
 
484 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.87 
 
 
414 aa  161  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.45 
 
 
484 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  45.88 
 
 
212 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.56 
 
 
484 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.87 
 
 
515 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.41 
 
 
482 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.69 
 
 
484 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.64 
 
 
404 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 
403 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.27 
 
 
404 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.38 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.38 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.38 
 
 
403 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.89 
 
 
484 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.38 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>