More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1983 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  100 
 
 
309 aa  618  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  73.87 
 
 
311 aa  441  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  71.43 
 
 
308 aa  431  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  69.58 
 
 
309 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  70.49 
 
 
310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  69.84 
 
 
309 aa  401  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  66.56 
 
 
310 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  66.56 
 
 
309 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  65.58 
 
 
308 aa  391  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  69.16 
 
 
309 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  70.65 
 
 
309 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  62.58 
 
 
311 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  67.97 
 
 
310 aa  384  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  65.03 
 
 
309 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  64.38 
 
 
309 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  64.71 
 
 
309 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  64.38 
 
 
309 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  65.26 
 
 
308 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  66.01 
 
 
311 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  65.69 
 
 
311 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  63.31 
 
 
308 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  61.89 
 
 
311 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  60.78 
 
 
311 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  62.78 
 
 
319 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  65.26 
 
 
309 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  64.71 
 
 
309 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  62.9 
 
 
327 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  66.01 
 
 
311 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  62.82 
 
 
316 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  62.01 
 
 
309 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  61.81 
 
 
327 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  62.46 
 
 
320 aa  363  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  63.93 
 
 
311 aa  363  1e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  66.01 
 
 
310 aa  362  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  66.01 
 
 
309 aa  361  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  62.58 
 
 
311 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  62.66 
 
 
328 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  60.33 
 
 
318 aa  359  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  63.84 
 
 
311 aa  359  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  61.17 
 
 
330 aa  359  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  65.36 
 
 
309 aa  358  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  61.64 
 
 
308 aa  358  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  60.59 
 
 
308 aa  358  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  61.81 
 
 
320 aa  358  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  60.97 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  62.46 
 
 
329 aa  356  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  62.42 
 
 
310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.69 
 
 
312 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  62.21 
 
 
309 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  59.02 
 
 
308 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  61.56 
 
 
310 aa  354  8.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.36 
 
 
312 aa  354  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.52 
 
 
317 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  61.31 
 
 
310 aa  353  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  60.26 
 
 
311 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  63.07 
 
 
314 aa  353  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  61.69 
 
 
327 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  64.05 
 
 
306 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  63.84 
 
 
323 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  60.33 
 
 
308 aa  352  2.9999999999999997e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  57.38 
 
 
311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  60 
 
 
309 aa  352  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  57.52 
 
 
307 aa  351  8e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  58.73 
 
 
317 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  61.49 
 
 
320 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  63.11 
 
 
320 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  60.84 
 
 
320 aa  350  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  58.9 
 
 
310 aa  349  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  61.24 
 
 
309 aa  349  4e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  60.33 
 
 
309 aa  348  6e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  60.19 
 
 
313 aa  347  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  61.17 
 
 
320 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  61.36 
 
 
326 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  61.36 
 
 
326 aa  346  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  57.14 
 
 
328 aa  345  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  60.06 
 
 
339 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  61.36 
 
 
325 aa  345  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  59.55 
 
 
328 aa  345  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  60.59 
 
 
311 aa  345  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  59.93 
 
 
311 aa  345  8e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  58.12 
 
 
311 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  60.84 
 
 
331 aa  343  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  59.74 
 
 
327 aa  342  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  59.74 
 
 
324 aa  342  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  56.05 
 
 
316 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  59.74 
 
 
316 aa  340  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  59.48 
 
 
309 aa  339  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  61.49 
 
 
321 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  56.19 
 
 
317 aa  339  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  60.39 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  60.59 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  56.82 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  54.25 
 
 
304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  54.19 
 
 
310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  58.14 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  55.74 
 
 
304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  55.87 
 
 
324 aa  335  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  59.35 
 
 
322 aa  335  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  57.61 
 
 
322 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  61.04 
 
 
332 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>