More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1944 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  76.02 
 
 
229 aa  329  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  66.18 
 
 
218 aa  280  8.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  38.5 
 
 
228 aa  155  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  38.94 
 
 
225 aa  148  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  38.03 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  32.42 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 
221 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 
221 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 
221 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  30.19 
 
 
221 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  29.25 
 
 
221 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  27.83 
 
 
221 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.15 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  29.74 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  29.73 
 
 
221 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4120  TrkA-N domain protein  34.09 
 
 
132 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  33.03 
 
 
231 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  27.56 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  31.16 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  32.19 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  30.48 
 
 
218 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 
465 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  32.02 
 
 
457 aa  93.2  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  28.24 
 
 
444 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 
449 aa  92.8  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  30.64 
 
 
457 aa  92.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
458 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 
458 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  32.66 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  30 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.68 
 
 
449 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  30.77 
 
 
445 aa  89.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29.21 
 
 
445 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  29.15 
 
 
223 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  25.45 
 
 
221 aa  89  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 
485 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 
465 aa  87.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.26 
 
 
207 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32 
 
 
626 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  29.6 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  26.63 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  30.41 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  28.85 
 
 
444 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.63 
 
 
628 aa  85.9  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  26.27 
 
 
222 aa  85.5  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  26.48 
 
 
450 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  30.24 
 
 
449 aa  85.1  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 
454 aa  85.5  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 
458 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 
458 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 
458 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 
458 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 
458 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  28.71 
 
 
458 aa  85.1  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  30.84 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  28.64 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
620 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  27.93 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  24.66 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  28.97 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  29.77 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  35.4 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  29.77 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  28.77 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  26.57 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  38.05 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  29.9 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2218  potassium transporter peripheral membrane component  26.67 
 
 
446 aa  82.8  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000230921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 
467 aa  82.8  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  26.34 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  29.61 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  43.97 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  27 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 
445 aa  82.4  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  29.41 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  26.57 
 
 
448 aa  82  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  30.33 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 
443 aa  82  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 
458 aa  81.6  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  32.88 
 
 
617 aa  80.9  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  28.11 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  31.07 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>