More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1899 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  100 
 
 
387 aa  793    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  77.52 
 
 
387 aa  630  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  73.39 
 
 
392 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  66.93 
 
 
392 aa  566  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  66.93 
 
 
387 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  57.22 
 
 
399 aa  480  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  54.78 
 
 
392 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  35.89 
 
 
810 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  36.6 
 
 
827 aa  249  5e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  34.84 
 
 
818 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  33.95 
 
 
776 aa  246  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  33.79 
 
 
827 aa  245  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  34.31 
 
 
830 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  34.52 
 
 
828 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  31.66 
 
 
833 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  34.52 
 
 
820 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  34.84 
 
 
832 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
818 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 
832 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  34.52 
 
 
361 aa  240  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  31.13 
 
 
832 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33.51 
 
 
821 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  35.64 
 
 
841 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
841 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  35.71 
 
 
830 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  33.97 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  32.96 
 
 
828 aa  233  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  33.7 
 
 
361 aa  232  9e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
834 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.78 
 
 
828 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  32.69 
 
 
843 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  32.41 
 
 
784 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  32.1 
 
 
784 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.43 
 
 
784 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  34.92 
 
 
828 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  32.1 
 
 
784 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  35.33 
 
 
820 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  32.15 
 
 
784 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  32.15 
 
 
784 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
816 aa  226  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
843 aa  226  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.15 
 
 
784 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  36.47 
 
 
347 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  32.15 
 
 
784 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  32.15 
 
 
784 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  35.5 
 
 
840 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  31 
 
 
785 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  34.07 
 
 
835 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  31.88 
 
 
784 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  36.24 
 
 
835 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.51 
 
 
836 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  35.2 
 
 
712 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  35.07 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.24 
 
 
836 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  35.62 
 
 
835 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  32.87 
 
 
842 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  33.25 
 
 
835 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.42 
 
 
837 aa  217  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.33 
 
 
842 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  35.53 
 
 
836 aa  216  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
854 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.63 
 
 
842 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  33.16 
 
 
842 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  32.17 
 
 
370 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  35.17 
 
 
836 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
367 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  31.12 
 
 
833 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.82 
 
 
347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  31.99 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.71 
 
 
343 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  34.77 
 
 
346 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.8 
 
 
357 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  36.27 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.07 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.95 
 
 
349 aa  173  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31 
 
 
389 aa  170  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  28.34 
 
 
357 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.23 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.62 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  30 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  29.24 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  29.29 
 
 
381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  28.92 
 
 
363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.32 
 
 
405 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  28.92 
 
 
370 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.66 
 
 
355 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.18 
 
 
392 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.18 
 
 
392 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  28.93 
 
 
365 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  25.34 
 
 
359 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.74 
 
 
364 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  27.73 
 
 
364 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  26.74 
 
 
364 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.4 
 
 
392 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.12 
 
 
392 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  26.84 
 
 
326 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.75 
 
 
376 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>