39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1841 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  59.75 
 
 
234 aa  293  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  57.33 
 
 
232 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  52.65 
 
 
230 aa  263  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  47.85 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  48.12 
 
 
177 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  28.34 
 
 
214 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  30.24 
 
 
206 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  27.27 
 
 
211 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  28.42 
 
 
214 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  30.43 
 
 
214 aa  101  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  27.93 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  28.36 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  28.89 
 
 
208 aa  92  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  26.7 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  28.25 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2915  protein of unknown function DUF116  30.08 
 
 
634 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  28.14 
 
 
354 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  26.63 
 
 
269 aa  72  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  27.01 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  23.53 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  28 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  24.64 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  24.68 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  28.08 
 
 
275 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  24.12 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  25.81 
 
 
269 aa  62  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  25.69 
 
 
298 aa  58.5  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  22.35 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  23.22 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  22.89 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  24 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  21.74 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  21.52 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  20.89 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  20.81 
 
 
258 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  21.79 
 
 
251 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  23.83 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  26.51 
 
 
193 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>