More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1833 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  624  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  57.89 
 
 
305 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  60.75 
 
 
295 aa  354  8.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0824  oxidoreductase domain protein  54.83 
 
 
303 aa  340  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268806  normal  0.234664 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  57.57 
 
 
303 aa  329  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  36.16 
 
 
353 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  35.28 
 
 
360 aa  178  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  36.01 
 
 
340 aa  178  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  37.09 
 
 
327 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  35.5 
 
 
354 aa  175  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  35.92 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  35.92 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 
359 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  36.04 
 
 
355 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  36.36 
 
 
340 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  35.44 
 
 
340 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  36.36 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  35.18 
 
 
356 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  35.44 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  35.29 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
327 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  33.75 
 
 
334 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  33.88 
 
 
319 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  34.89 
 
 
335 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  34.57 
 
 
334 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  33.87 
 
 
334 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  36.89 
 
 
340 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  34.41 
 
 
335 aa  156  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 
320 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  33.97 
 
 
341 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.76 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  31.83 
 
 
318 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  35.16 
 
 
346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
315 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  31.13 
 
 
313 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  32.8 
 
 
316 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 
355 aa  138  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  32.33 
 
 
310 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  33.22 
 
 
322 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.9 
 
 
313 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
317 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
344 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  31.31 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.45 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  27.99 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  31.01 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  31.01 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.8 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
344 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 
353 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.78 
 
 
319 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 
311 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
344 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.64 
 
 
352 aa  123  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  30.77 
 
 
649 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  28.76 
 
 
320 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 
337 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  30 
 
 
332 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  28.76 
 
 
320 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
320 aa  119  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.87 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.38 
 
 
346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
359 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.9 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.38 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 
347 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  30.57 
 
 
332 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  25.39 
 
 
311 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  30.09 
 
 
328 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2203  oxidoreductase-like  28.71 
 
 
334 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
310 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 
338 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 
326 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
335 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 
344 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
344 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0864  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 
318 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  28.84 
 
 
332 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
337 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  29.19 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  27.06 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  32.39 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 
343 aa  95.9  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3133  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.686655  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  30.16 
 
 
330 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0981  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  33.68 
 
 
383 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 
383 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>