46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1829 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  63.46 
 
 		 159 aa  190  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  64.1 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  57.33 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  54.67 
 
 		 152 aa  161  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  53.42 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  48.32 
 
 		 156 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  51.3 
 
 		 155 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  42.86 
 
 		 606 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  45.39 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  43.9 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  41.5 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  45.03 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  36.02 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  45.45 
 
 		 161 aa  102  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  37.25 
 
 		 649 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  38.85 
 
 		 652 aa  99.8  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.24 
 
 		 649 aa  98.2  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  35.95 
 
 		 649 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.64 
 
 		 649 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  37.33 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  31.17 
 
 		 634 aa  67.8  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.24 
 
 		 585 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  37.42 
 
 		 566 aa  65.1  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.24 
 
 		 608 aa  64.3  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  30.92 
 
 		 615 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  30.38 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  35.86 
 
 		 546 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  35.76 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  34.51 
 
 		 541 aa  58.5  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  47.95 
 
 		 546 aa  58.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  34.43 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.57 
 
 		 582 aa  57  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  33.76 
 
 		 600 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1830  PUA domain containing protein  34.27 
 
 		 541 aa  51.2  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.214323  normal  0.168239 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  30.07 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  43.84 
 
 		 544 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  26 
 
 		 633 aa  48.9  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25 
 
 		 580 aa  44.7  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  41.18 
 
 		 60 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  27.41 
 
 		 472 aa  42.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  29.87 
 
 		 590 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  35.59 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  34.78 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 		 158 aa  41.2  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>