More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1812 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1390 aa  2833    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 1177 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 		 3706 aa  315  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 1676 aa  308  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 1654 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 1253 aa  280  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 1714 aa  274  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 789 aa  268  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 1246 aa  267  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 1093 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 1093 aa  262  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 		 1791 aa  259  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 964 aa  259  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 980 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 968 aa  254  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 771 aa  244  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.25 
 
 		 1248 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.07 
 
 		 783 aa  239  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 945 aa  239  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 886 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.84 
 
 		 1094 aa  238  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 815 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1210 aa  235  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1182 aa  234  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 991 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.4 
 
 		 744 aa  221  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 1239 aa  215  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 681 aa  211  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 488 aa  208  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 572 aa  206  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 547 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 347 aa  199  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 613 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 2693 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 746 aa  195  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 1227 aa  194  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 839 aa  192  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 764 aa  190  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  28.96 
 
 		 917 aa  189  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 892 aa  188  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 872 aa  188  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  24.73 
 
 		 1561 aa  186  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 909 aa  186  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 945 aa  185  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 912 aa  185  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  28.44 
 
 		 754 aa  184  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 932 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 1741 aa  183  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 688 aa  183  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 608 aa  182  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 856 aa  181  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 819 aa  179  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 551 aa  179  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 439 aa  178  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 704 aa  178  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 941 aa  178  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  24.56 
 
 		 1379 aa  177  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 657 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 790 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 878 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 382 aa  174  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 767 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.82 
 
 		 1428 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 1051 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 		 1439 aa  172  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.52 
 
 		 1273 aa  172  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 1426 aa  171  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 526 aa  172  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  23.93 
 
 		 1113 aa  171  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 1267 aa  171  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  26.51 
 
 		 821 aa  170  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  29.73 
 
 		 676 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 585 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 674 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 1532 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 924 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 841 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 215 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.47 
 
 		 1078 aa  166  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 631 aa  166  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 1051 aa  166  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 723 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 913 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.16 
 
 		 878 aa  164  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 788 aa  163  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 891 aa  163  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 727 aa  162  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 1205 aa  162  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 834 aa  162  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 		 1418 aa  162  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  28.63 
 
 		 918 aa  161  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 		 1121 aa  161  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 472 aa  161  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.61 
 
 		 1509 aa  160  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  39.07 
 
 		 449 aa  160  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 904 aa  160  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 		 1977 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 1560 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 1047 aa  158  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 813 aa  158  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>