More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1806 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
681 aa  1404    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
1253 aa  243  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.59 
 
 
783 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
980 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
1093 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
1093 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
878 aa  239  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
526 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
551 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.84 
 
 
744 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
839 aa  220  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  32.55 
 
 
676 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
771 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
788 aa  214  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
1177 aa  213  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
547 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
932 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
1390 aa  211  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
1676 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
1227 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
815 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
572 aa  209  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
913 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
945 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
488 aa  207  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 
1654 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.04 
 
 
1210 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
3706 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.2 
 
 
1239 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  32.1 
 
 
945 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
439 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  28.99 
 
 
746 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
764 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
964 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
1051 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
872 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  29.53 
 
 
886 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
1246 aa  194  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
1714 aa  193  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.85 
 
 
1248 aa  193  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
631 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  32.29 
 
 
918 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
834 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
1560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 
472 aa  184  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
674 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.46 
 
 
754 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
991 aa  180  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
347 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
941 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  27.41 
 
 
892 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
2693 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  30.66 
 
 
1047 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.29 
 
 
1182 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
1051 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
613 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
732 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
215 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
727 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
723 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40 
 
 
1663 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  30.12 
 
 
657 aa  164  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
1183 aa  163  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
767 aa  163  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  31.41 
 
 
682 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
924 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.5 
 
 
1668 aa  163  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
909 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
912 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
739 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  29.34 
 
 
492 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.18 
 
 
704 aa  161  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
782 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
462 aa  160  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
747 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  37.98 
 
 
936 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
382 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
739 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
757 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
856 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
749 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
1093 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
535 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30.36 
 
 
449 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
832 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
437 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  40.38 
 
 
1289 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
746 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
585 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  34.97 
 
 
800 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
790 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
493 aa  147  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
272 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
774 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
532 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
752 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
813 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
698 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
603 aa  143  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>