More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1768 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
352 aa  727    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000159776  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.81 
 
 
353 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.09 
 
 
353 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.316579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.95 
 
 
355 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3352  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  54.83 
 
 
355 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.57 
 
 
355 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0680968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 
355 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 
354 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 
368 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
339 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
369 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
367 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  33.05 
 
 
338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
339 aa  156  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
363 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 
339 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
341 aa  149  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
363 aa  149  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
352 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
352 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
352 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
367 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
685 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
680 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
364 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
342 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
669 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.4 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
373 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
684 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.17 
 
 
342 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  30.4 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.16 
 
 
357 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
357 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
357 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
363 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
672 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
672 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
353 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
358 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.65 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0259  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
357 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.86 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.73 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.89 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.86 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.15 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
354 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.73 
 
 
338 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
360 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.13 
 
 
341 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
354 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.83 
 
 
342 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
311 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.26 
 
 
327 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.35 
 
 
318 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.32 
 
 
307 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.73 
 
 
336 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.59 
 
 
348 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.81 
 
 
356 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.73 
 
 
336 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.8 
 
 
310 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.63 
 
 
352 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.89 
 
 
336 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.17 
 
 
330 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  26.51 
 
 
329 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.04 
 
 
340 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
314 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.61 
 
 
307 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.55 
 
 
340 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.63 
 
 
322 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.57 
 
 
316 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.12 
 
 
328 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.226707  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.61 
 
 
336 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.39 
 
 
354 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1222  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  25.98 
 
 
348 aa  103  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.02 
 
 
340 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  28.53 
 
 
320 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0125  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.25 
 
 
329 aa  102  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000332507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.12 
 
 
323 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 
308 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.23 
 
 
349 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.53 
 
 
350 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.27 
 
 
341 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.35 
 
 
322 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  27.78 
 
 
331 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.84 
 
 
356 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524405  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.78 
 
 
323 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.36 
 
 
318 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1683  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.83 
 
 
363 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.429769  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.94 
 
 
353 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>