94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1668 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1237  protein of unknown function Met10  58.9 
 
 
289 aa  341  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.220421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  52.23 
 
 
288 aa  290  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  48.8 
 
 
289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  39.73 
 
 
288 aa  246  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  31.23 
 
 
343 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0736  protein of unknown function Met10  35.56 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0636  protein of unknown function Met10  29.26 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  33.46 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0655  methyltransferase  32.69 
 
 
337 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  33 
 
 
346 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  38.27 
 
 
365 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1579  protein of unknown function Met10  29.6 
 
 
253 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.891505  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0202  protein of unknown function Met10  46.92 
 
 
416 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  45.74 
 
 
409 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0333  protein of unknown function Met10  29.74 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  27.57 
 
 
256 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1047  methyltransferase  30.46 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  33.65 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  32.66 
 
 
326 aa  85.9  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  32.06 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  32.69 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  35 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  32.5 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  28.36 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  36.52 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  26.4 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  32.65 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  26.38 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  29.55 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  26.12 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  27.4 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  30.11 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  30.98 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  29.07 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  30.07 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  28.72 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  29.61 
 
 
344 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  26.8 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  26.13 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  30.11 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  25.87 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  28 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  25 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  28.04 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38572  predicted protein  29.45 
 
 
410 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00890076 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.3 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  26.4 
 
 
342 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  30.28 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1851  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.9 
 
 
445 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  41.77 
 
 
294 aa  52.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.37 
 
 
443 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.75 
 
 
312 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  27.47 
 
 
436 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.52 
 
 
465 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.14 
 
 
434 aa  49.7  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.23 
 
 
449 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  30.25 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  23.96 
 
 
259 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0041  protein of unknown function Met10  25 
 
 
272 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  32.1 
 
 
327 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  24.1 
 
 
439 aa  47  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4728  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.21 
 
 
409 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.228572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.37 
 
 
463 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.98 
 
 
491 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0203471  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 
414 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1209  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.91 
 
 
450 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0851  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  32.98 
 
 
432 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954916  hitchhiker  0.000117621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.57 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.64 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  34 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.33 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0844867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2107  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.37 
 
 
465 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0801  23S rRNA methyltransferase/RumA  43.64 
 
 
447 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.64 
 
 
463 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01900  tRNA (guanine) methyltransferase, putative  35.48 
 
 
543 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3004  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.1 
 
 
441 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2348  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34 
 
 
472 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1755  (Uracil-5)-methyltransferase  36.23 
 
 
391 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.38216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0352  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
434 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  40.68 
 
 
319 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1839  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35 
 
 
472 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0012393  normal  0.235598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  31.73 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  26.87 
 
 
428 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  38.55 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.71 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
315 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.64 
 
 
442 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0061  FkbM family methyltransferase  39.22 
 
 
259 aa  42.7  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  31.31 
 
 
436 aa  42.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1480  RNA methyltransferase, TrmA family  32.89 
 
 
442 aa  42.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45914  predicted protein  28.04 
 
 
459 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
243 aa  42.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>