More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1646 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  783    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  62.16 
 
 
410 aa  472  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  61.48 
 
 
407 aa  457  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  45.7 
 
 
408 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  47.97 
 
 
390 aa  322  7e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  42 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  42.39 
 
 
393 aa  276  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  41.56 
 
 
381 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  41.19 
 
 
397 aa  273  6e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  41.03 
 
 
402 aa  255  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  36.7 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  35.32 
 
 
413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  40.46 
 
 
430 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  36.95 
 
 
397 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  32.32 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  30.98 
 
 
367 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  32.32 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.41 
 
 
400 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.29 
 
 
400 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
406 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.63 
 
 
403 aa  119  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.16 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  29.33 
 
 
402 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.84 
 
 
391 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  27.43 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  26.83 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 
405 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 
404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.05 
 
 
400 aa  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.5 
 
 
397 aa  113  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 
452 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 
406 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.57 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
413 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 
401 aa  111  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 
405 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  26.96 
 
 
397 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  25.61 
 
 
402 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  25.62 
 
 
395 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  27.14 
 
 
409 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 
406 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  28.29 
 
 
397 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  25.98 
 
 
397 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  25.65 
 
 
412 aa  107  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 
400 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.51 
 
 
403 aa  106  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
400 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  26.89 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
402 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  26.21 
 
 
402 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
443 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  26.42 
 
 
397 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  33.8 
 
 
454 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 
409 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  26.94 
 
 
408 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  25.86 
 
 
401 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  24.37 
 
 
663 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  25.81 
 
 
661 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 
414 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  25.98 
 
 
397 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.86 
 
 
405 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 
409 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 
409 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.1 
 
 
404 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  26.09 
 
 
644 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  26.36 
 
 
645 aa  101  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.1 
 
 
404 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  24.11 
 
 
663 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  25.12 
 
 
696 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  25 
 
 
410 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  23.7 
 
 
657 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  27.23 
 
 
671 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.23 
 
 
409 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.07 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  26.09 
 
 
397 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.46 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  26.57 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  24.82 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  29.82 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  23.11 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  25.47 
 
 
643 aa  97.4  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  28.37 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.46 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.59 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  21.95 
 
 
657 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  36.6 
 
 
423 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 
412 aa  96.3  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  25.48 
 
 
653 aa  96.3  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  24.16 
 
 
657 aa  96.3  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  28.63 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  25.18 
 
 
670 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.05 
 
 
642 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  27.92 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  26.46 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  26.73 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
409 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.81 
 
 
414 aa  94  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
409 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 
408 aa  93.2  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>