233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1641 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  100 
 
 
69 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  65.22 
 
 
69 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  66.67 
 
 
69 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  68.12 
 
 
69 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  64.71 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  62.32 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  62.32 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  62.32 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  62.32 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3108  TOBE domain-containing protein  63.77 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0224442  hitchhiker  0.00000231206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  65.22 
 
 
69 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  59.42 
 
 
69 aa  83.6  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3942  molybdenum-pterin binding protein  60.87 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  59.7 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  57.97 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  59.42 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  59.42 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1609  TOBE domain-containing protein  59.42 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2745  TOBE domain protein  59.42 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239742  normal  0.422578 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  57.58 
 
 
281 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  50.72 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  55.07 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  57.97 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  57.97 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  57.97 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  55.07 
 
 
69 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  57.97 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0662  TOBE domain-containing protein  63.77 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.384686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  52.24 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  55.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  53.62 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  55.07 
 
 
278 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  55.07 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  51.47 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  57.97 
 
 
70 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  53.62 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  53.62 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  54.41 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  53.62 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  55.88 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  54.41 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  53.62 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  53.62 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  53.62 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  53.62 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  51.47 
 
 
278 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  53.73 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  51.47 
 
 
281 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2558  molybdenum-pterin binding protein  56.52 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0127714  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  54.41 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  55.07 
 
 
69 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  51.47 
 
 
281 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  49.25 
 
 
262 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  49.25 
 
 
262 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0412  TOBE domain protein  53.62 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  47.76 
 
 
278 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  53.73 
 
 
267 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0277  TOBE domain protein  55.22 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0114044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  49.25 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  52.94 
 
 
279 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  52.17 
 
 
278 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  52.17 
 
 
282 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  51.52 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  47.76 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  51.47 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  47.83 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  53.62 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  52.94 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  52.94 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  47.76 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  52.17 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  55.88 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  47.83 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  51.47 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  54.41 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  59.65 
 
 
269 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  52.94 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  46.38 
 
 
268 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  52.17 
 
 
269 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  43.48 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  51.52 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3768  TOBE domain protein  50.72 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  49.23 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  50 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  54.41 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  52.17 
 
 
69 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  49.25 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2423  molybdenum-pterin binding protein  55.07 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000074604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  55.36 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  50.72 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  46.38 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  47.83 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  49.28 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  49.3 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  46.38 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>