More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1634 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  54.4 
 
 		 644 aa  705    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  66.71 
 
 		 656 aa  941    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  49.03 
 
 		 649 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  51.55 
 
 		 637 aa  704    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  53.25 
 
 		 644 aa  702    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  50.76 
 
 		 645 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  61.99 
 
 		 675 aa  895    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1634  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 708 aa  1461    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000582851  hitchhiker  0.000898108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  50.84 
 
 		 651 aa  684    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  67.94 
 
 		 665 aa  969    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  68.08 
 
 		 651 aa  937    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  52.31 
 
 		 795 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  61.1 
 
 		 628 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  49.23 
 
 		 645 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2927  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.18 
 
 		 643 aa  598  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  49.37 
 
 		 645 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  62.47 
 
 		 633 aa  594  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  48.16 
 
 		 652 aa  594  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  45.97 
 
 		 670 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  46.85 
 
 		 648 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.5 
 
 		 642 aa  579  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  60.81 
 
 		 633 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  57.65 
 
 		 632 aa  568  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  46.85 
 
 		 719 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  61.31 
 
 		 636 aa  568  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  45.87 
 
 		 685 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  60.63 
 
 		 642 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0003  DNA gyrase subunit B  48.57 
 
 		 823 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0806649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4460  DNA gyrase subunit B  48.57 
 
 		 823 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318757  normal  0.407237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  56.96 
 
 		 640 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  59.28 
 
 		 635 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  47.38 
 
 		 804 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.83 
 
 		 641 aa  555  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  48.1 
 
 		 807 aa  555  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0003  DNA gyrase subunit B  48.57 
 
 		 823 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211892  hitchhiker  0.00365115 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  58.82 
 
 		 635 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3440  DNA gyrase subunit B  48.34 
 
 		 842 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.683175  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  46.18 
 
 		 832 aa  552  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  59.87 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  48.79 
 
 		 804 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0012  DNA gyrase subunit B  48.17 
 
 		 805 aa  545  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0964  DNA gyrase, B subunit  46.92 
 
 		 812 aa  546  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.780109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  56.3 
 
 		 650 aa  547  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  57.02 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0157  DNA gyrase subunit B  48.6 
 
 		 830 aa  548  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374605  normal  0.0722836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0003  DNA gyrase subunit B  47.34 
 
 		 841 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  58.07 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2326  DNA topoisomerase IV subunit B  40.25 
 
 		 648 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  58.07 
 
 		 638 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2040  DNA topoisomerase IV subunit B  40.25 
 
 		 648 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  44.95 
 
 		 688 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0003  DNA gyrase, B subunit  45.73 
 
 		 832 aa  544  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0724029  normal  0.0722311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  56.12 
 
 		 644 aa  544  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  57.77 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0004  DNA gyrase, B subunit  46.33 
 
 		 813 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.821769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  45.61 
 
 		 711 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0003  DNA gyrase, B subunit  49.14 
 
 		 868 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  49.53 
 
 		 851 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0003  DNA gyrase subunit B  47.86 
 
 		 841 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0005  DNA gyrase, B subunit  47.76 
 
 		 801 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  55.62 
 
 		 644 aa  537  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50.75 
 
 		 637 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  55.32 
 
 		 644 aa  538  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.09 
 
 		 633 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  57.14 
 
 		 640 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  48.39 
 
 		 805 aa  535  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  55.35 
 
 		 634 aa  534  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0007  DNA gyrase, B subunit  48.33 
 
 		 814 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000127648 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  58.32 
 
 		 640 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  55 
 
 		 643 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  56.72 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  56.72 
 
 		 640 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  54.01 
 
 		 636 aa  530  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0004  DNA gyrase, B subunit  48.23 
 
 		 805 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.545421  hitchhiker  0.00000387143 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03480  DNA gyrase subunit B  47.66 
 
 		 814 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0003  DNA gyrase subunit B  48.37 
 
 		 877 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  56.72 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.49 
 
 		 701 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  56.51 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  56.51 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  56.21 
 
 		 637 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  56.3 
 
 		 640 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  56.51 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  41.89 
 
 		 702 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  46.68 
 
 		 805 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  55.49 
 
 		 644 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  56.51 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  56.51 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  56.3 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  46.22 
 
 		 806 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  46 
 
 		 806 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0003  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 842 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  54.7 
 
 		 643 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0003  DNA gyrase subunit B  47.07 
 
 		 842 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0003  DNA gyrase subunit B  46.56 
 
 		 823 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  52.32 
 
 		 695 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0004  DNA gyrase subunit B  46.44 
 
 		 803 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  55.88 
 
 		 640 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0009  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.85 
 
 		 813 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.983538  hitchhiker  0.00000000705515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1988  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.31 
 
 		 715 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>