More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1605 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  100 
 
 		 162 aa  333  5.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  70 
 
 		 175 aa  233  8e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  42.11 
 
 		 192 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  44.97 
 
 		 210 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  41.03 
 
 		 204 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  40.26 
 
 		 226 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  42.76 
 
 		 195 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  41.03 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  38.56 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  35.71 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  42.52 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  37.8 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  39.86 
 
 		 221 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  38.41 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  40.94 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  42.54 
 
 		 208 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  35.71 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  39.74 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 		 213 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 		 188 aa  98.2  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 		 188 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 		 188 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.36 
 
 		 194 aa  97.4  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  39.85 
 
 		 274 aa  94.7  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  37.82 
 
 		 184 aa  94.4  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  37.5 
 
 		 208 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  36.18 
 
 		 197 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.1 
 
 		 207 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  32.69 
 
 		 206 aa  92.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  37.91 
 
 		 225 aa  92  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  36.96 
 
 		 191 aa  90.5  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.84 
 
 		 189 aa  90.5  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  34.29 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  40.27 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  40.27 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  37.21 
 
 		 206 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  30.97 
 
 		 190 aa  87.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  36.05 
 
 		 179 aa  87  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  34.15 
 
 		 201 aa  86.3  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  36.23 
 
 		 246 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  31.82 
 
 		 186 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  32.89 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  33.33 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  32.3 
 
 		 200 aa  84.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  32.03 
 
 		 198 aa  84  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  32.45 
 
 		 202 aa  84  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.94 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  31.65 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  37.21 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  31.87 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  31.41 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  30.92 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  35.48 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  31.37 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.81 
 
 		 223 aa  80.9  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  31.06 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  34.53 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  35.94 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  34.04 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  33.82 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  30.67 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  31.11 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  32.21 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  28.86 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  33.85 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  33.33 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  30.67 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  33.97 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  32.05 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  30.46 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  33.6 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  29.87 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  33.06 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  29.87 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0088  GrpE protein  33.77 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.141966  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  31.17 
 
 		 203 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  29.69 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  29.61 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  31.75 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  30.61 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  29.22 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  32.9 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  31.41 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  30.22 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  34.65 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.51 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  29.3 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>