More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1601 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 491 aa  966    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  42.27 
 
 		 930 aa  300  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  39.02 
 
 		 752 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  51.04 
 
 		 346 aa  275  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  47.65 
 
 		 668 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  41.15 
 
 		 930 aa  250  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  43 
 
 		 831 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  45.1 
 
 		 676 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  40.72 
 
 		 579 aa  239  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  41.56 
 
 		 627 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  42.72 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.86 
 
 		 343 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  45.89 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  43.71 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  42.55 
 
 		 1293 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  40 
 
 		 709 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  39.22 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  35.7 
 
 		 786 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  34.42 
 
 		 588 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  33.57 
 
 		 319 aa  176  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  31.58 
 
 		 392 aa  169  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  34.56 
 
 		 1030 aa  153  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  34.56 
 
 		 1146 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  34.2 
 
 		 1163 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  34.32 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  30.16 
 
 		 903 aa  138  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1068 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.77 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.1 
 
 		 307 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  29.68 
 
 		 525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  33.08 
 
 		 365 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.59 
 
 		 373 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  34.26 
 
 		 359 aa  127  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  32.86 
 
 		 1140 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  29.27 
 
 		 363 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  29.52 
 
 		 360 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  29.61 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  32.42 
 
 		 1177 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  31.52 
 
 		 1079 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  29.75 
 
 		 372 aa  120  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  32.52 
 
 		 353 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.57 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  32.26 
 
 		 646 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.85 
 
 		 2296 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  27.4 
 
 		 418 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  31.03 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  26.94 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  28.85 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  29.71 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  29.86 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.79 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 		 850 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  30.8 
 
 		 1834 aa  108  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1051 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  27.44 
 
 		 700 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.41 
 
 		 693 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  28.83 
 
 		 322 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  28.03 
 
 		 321 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  29.94 
 
 		 963 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.48 
 
 		 1130 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.09 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1351 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  31.72 
 
 		 1026 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  28.52 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1030 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  60.47 
 
 		 910 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  26.3 
 
 		 323 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1750 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.95 
 
 		 639 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  32.62 
 
 		 888 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  33.67 
 
 		 899 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.96 
 
 		 343 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  30.09 
 
 		 318 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  35.79 
 
 		 898 aa  96.7  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  25.84 
 
 		 326 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  28.77 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.16 
 
 		 1292 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  34.14 
 
 		 664 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  28.62 
 
 		 906 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  27 
 
 		 732 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  28.32 
 
 		 315 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  54.29 
 
 		 1783 aa  90.9  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  25.12 
 
 		 303 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 		 892 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 379 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  27.7 
 
 		 386 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.44 
 
 		 1094 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1230 aa  87  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  23.91 
 
 		 328 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  28.39 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  26.92 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  29.25 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  31.17 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  42.34 
 
 		 791 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  45.45 
 
 		 669 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  37.97 
 
 		 528 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  27.37 
 
 		 615 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  43.27 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  24.5 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  33.91 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>