More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1579 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  100 
 
 		 170 aa  337  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  68.46 
 
 		 907 aa  203  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  62.34 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  47.2 
 
 		 779 aa  153  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  46.79 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  39.47 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  37.58 
 
 		 177 aa  100  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  39.87 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  36 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  36.6 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  36 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  37.66 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  37.5 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  36 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  38.22 
 
 		 174 aa  94.4  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  37.09 
 
 		 190 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  32.26 
 
 		 200 aa  91.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  38.41 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  36.42 
 
 		 404 aa  88.2  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  37.58 
 
 		 146 aa  88.2  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  41.28 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.33 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  36.88 
 
 		 136 aa  84.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  36.67 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  40.32 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  35.1 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  31.33 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35.37 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  33.56 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.92 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  38.02 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  31.71 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  34.46 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  34.69 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.45 
 
 		 518 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.14 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  39.67 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  29.53 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.97 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.73 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.73 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  37.24 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  34.71 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  28 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  32.65 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  29.73 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  32.43 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  37.24 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.66 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  32.88 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  36.55 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  29.88 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  30.33 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  31.76 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.91 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  31.76 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.97 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.03 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  30.95 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.03 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  33.99 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  26.02 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.47 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  31.45 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.77 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.28 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  34.03 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  38.1 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.34 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  27.81 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.28 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.28 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.27 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  30.26 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.28 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  32.43 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.28 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  32.43 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.28 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  27.59 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.28 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2533  CheW protein  28.21 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.28 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  29.73 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  31.08 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  28.28 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  31.08 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  29.14 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  34.15 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  34.15 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  30.08 
 
 		 344 aa  71.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.28 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  30.71 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.28 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  30.49 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  29.51 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.55 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>