157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1555 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  69.35 
 
 
186 aa  283  9e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  68.48 
 
 
186 aa  282  2e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  49.47 
 
 
216 aa  186  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  7.09652e-06 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.95 
 
 
185 aa  171  6e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  47.09 
 
 
184 aa  162  2e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  44.62 
 
 
189 aa  161  5e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  38.38 
 
 
185 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.34 
 
 
186 aa  145  4e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 
215 aa  135  3e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  39.86 
 
 
165 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  35.08 
 
 
191 aa  117  1e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.23 
 
 
190 aa  116  2e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.74 
 
 
192 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
190 aa  115  4e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  36.02 
 
 
188 aa  114  7e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  36.56 
 
 
189 aa  112  2e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.59 
 
 
193 aa  112  2e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  37.3 
 
 
189 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.57 
 
 
189 aa  110  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.45 
 
 
190 aa  109  2e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  37.1 
 
 
189 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.47 
 
 
194 aa  107  7e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  36.56 
 
 
188 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
200 aa  104  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  5.00824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.95 
 
 
190 aa  104  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.39 
 
 
190 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.23527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  35.23 
 
 
190 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.56 
 
 
189 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.43 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  31.72 
 
 
189 aa  99  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.14 
 
 
195 aa  99  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.39 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  4.89831e-08 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  30.89 
 
 
189 aa  87  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  32.92 
 
 
195 aa  84.7  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.9 
 
 
194 aa  84.3  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  32.02 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.47 
 
 
192 aa  81.3  7e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.47 
 
 
192 aa  81.3  7e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.01 
 
 
197 aa  70.5  2e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.01 
 
 
160 aa  68.2  7e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  30.15 
 
 
192 aa  67.8  8e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  33.1 
 
 
205 aa  67.8  9e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  31.94 
 
 
199 aa  65.1  6e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.73 
 
 
183 aa  63.9  1e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  29.69 
 
 
187 aa  64.3  1e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  3.03002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  29.86 
 
 
202 aa  61.2  9e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  32.79 
 
 
149 aa  60.1  2e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  32.79 
 
 
149 aa  60.1  2e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.56 
 
 
215 aa  59.7  2e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  28.68 
 
 
177 aa  59.3  3e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  28.74 
 
 
195 aa  58.9  4e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.03 
 
 
194 aa  58.5  6e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  28.46 
 
 
185 aa  57.4  1e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  29.84 
 
 
152 aa  56.6  2e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.16 
 
 
185 aa  56.2  2e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.91 
 
 
189 aa  56.2  3e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  26.36 
 
 
178 aa  55.8  3e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.15 
 
 
167 aa  55.5  5e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.73643e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.03 
 
 
186 aa  54.3  1e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.77 
 
 
168 aa  53.1  2e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  29.23 
 
 
185 aa  53.5  2e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  26.47 
 
 
188 aa  52.4  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  25.95 
 
 
178 aa  52.4  4e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  24.63 
 
 
184 aa  52  5e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  4.40007e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.92 
 
 
176 aa  51.6  7e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.74 
 
 
189 aa  51.6  7e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  28.74 
 
 
189 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  24.81 
 
 
176 aa  50.8  1e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  28.74 
 
 
189 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  24.85 
 
 
204 aa  50.8  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.5 
 
 
177 aa  50.4  1e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  28.74 
 
 
189 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  28.74 
 
 
189 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  25.69 
 
 
208 aa  49.7  2e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  28.74 
 
 
189 aa  50.4  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  29.2 
 
 
192 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  28.14 
 
 
189 aa  50.1  2e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.06 
 
 
187 aa  49.3  3e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
190 aa  49.7  3e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.81 
 
 
159 aa  49.3  3e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.48 
 
 
192 aa  48.9  4e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.89 
 
 
195 aa  48.5  5e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  28.1 
 
 
201 aa  48.1  6e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  28.1 
 
 
201 aa  48.1  6e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.1 
 
 
201 aa  48.1  6e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  27.27 
 
 
180 aa  48.1  7e-05  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  28.29 
 
 
186 aa  48.1  7e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.17 
 
 
164 aa  48.1  7e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  27.01 
 
 
160 aa  48.1  8e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  28.37 
 
 
162 aa  47.8  9e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  26.36 
 
 
176 aa  47.8  9e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  24.19 
 
 
164 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.17 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  36.14 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.78 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.81 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.81 
 
 
225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  29.14 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>