More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1464 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 579 aa  1187    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 		 576 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 800 aa  295  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 1329 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 659 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 793 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 543 aa  261  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 		 625 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.6 
 
 		 466 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 628 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 903 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 		 593 aa  197  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 		 659 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.08 
 
 		 608 aa  189  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 629 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 807 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  44.09 
 
 		 605 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  42.92 
 
 		 980 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 735 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 414 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 592 aa  161  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 477 aa  152  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 		 1049 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  33.84 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2357  putative PAS/PAC sensor protein  39.67 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 452 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0987  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 451 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.5 
 
 		 869 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.96 
 
 		 869 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0252  putative PAS/PAC sensor protein  36.98 
 
 		 306 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 		 701 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 234 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  44.17 
 
 		 934 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  31.74 
 
 		 387 aa  107  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  41.09 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 125 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  39.69 
 
 		 234 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 236 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0255  DNA-binding response regulator  32.79 
 
 		 226 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 464 aa  103  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  31.87 
 
 		 230 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 236 aa  101  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 219 aa  101  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 235 aa  101  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4952  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 229 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 372 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.31 
 
 		 232 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3179  DNA-binding response regulator VicR  32.79 
 
 		 226 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0879082  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  40.15 
 
 		 1355 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 		 328 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.4 
 
 		 235 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 228 aa  99.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 202 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 236 aa  99.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 235 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 229 aa  99.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 431 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  42.5 
 
 		 1373 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.13 
 
 		 235 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 238 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 385 aa  99.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  31.32 
 
 		 229 aa  99.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 238 aa  99.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.130175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 309 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 235 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  36.15 
 
 		 230 aa  98.2  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  28.05 
 
 		 229 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  98.2  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 234 aa  97.8  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4707  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 229 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4546  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 229 aa  97.8  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5068  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 229 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 120 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4932  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 229 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>