More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1423 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  46.33 
 
 		 1094 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 1361 aa  2710    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  44.42 
 
 		 1667 aa  710    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  42.76 
 
 		 1862 aa  610  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  46.7 
 
 		 2272 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  49.03 
 
 		 1682 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  45.74 
 
 		 963 aa  522  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  51.72 
 
 		 1842 aa  506  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  41.57 
 
 		 1282 aa  493  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  50.19 
 
 		 978 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  39.95 
 
 		 941 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.34 
 
 		 1528 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  36.28 
 
 		 1387 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  53.99 
 
 		 752 aa  440  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  43.73 
 
 		 1667 aa  433  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  55.48 
 
 		 1356 aa  428  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  52.71 
 
 		 1882 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  51.52 
 
 		 735 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  51.76 
 
 		 2036 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  45.98 
 
 		 561 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.17 
 
 		 1783 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  53.62 
 
 		 2554 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  49.89 
 
 		 2122 aa  400  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  50.59 
 
 		 575 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  50.23 
 
 		 2000 aa  393  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  45.5 
 
 		 1236 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  47.09 
 
 		 528 aa  382  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  41.4 
 
 		 838 aa  380  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.3 
 
 		 2176 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  52.97 
 
 		 675 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  53.87 
 
 		 1300 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.5 
 
 		 530 aa  356  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  54.17 
 
 		 713 aa  352  3e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  52.68 
 
 		 679 aa  348  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  51.59 
 
 		 669 aa  346  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  52.4 
 
 		 859 aa  346  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  54.17 
 
 		 658 aa  340  9e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  51.78 
 
 		 685 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  49 
 
 		 1120 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  43.87 
 
 		 930 aa  335  4e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  49.6 
 
 		 1241 aa  332  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  50.59 
 
 		 1969 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  32.59 
 
 		 1011 aa  322  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  31.02 
 
 		 1814 aa  319  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  45.02 
 
 		 1732 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  40.26 
 
 		 958 aa  307  9.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  46.3 
 
 		 460 aa  290  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  52.51 
 
 		 910 aa  280  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.81 
 
 		 1606 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  31.63 
 
 		 865 aa  276  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  55.6 
 
 		 581 aa  274  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  57.59 
 
 		 3295 aa  273  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  52.99 
 
 		 551 aa  268  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  50.52 
 
 		 615 aa  266  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  49.01 
 
 		 547 aa  262  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  30.71 
 
 		 952 aa  258  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  49.45 
 
 		 791 aa  254  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  44.71 
 
 		 861 aa  249  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  44.93 
 
 		 971 aa  243  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.7 
 
 		 1620 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.64 
 
 		 869 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  28.25 
 
 		 1602 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  38.62 
 
 		 870 aa  214  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  39.38 
 
 		 1292 aa  214  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.07 
 
 		 845 aa  213  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.89 
 
 		 823 aa  209  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.98 
 
 		 719 aa  206  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  40.5 
 
 		 443 aa  204  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.47 
 
 		 802 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  31.6 
 
 		 1531 aa  201  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  47.98 
 
 		 2552 aa  201  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  39.72 
 
 		 519 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.94 
 
 		 840 aa  199  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  39.53 
 
 		 930 aa  194  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  55.29 
 
 		 560 aa  189  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.24 
 
 		 439 aa  186  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.07 
 
 		 786 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  46.8 
 
 		 819 aa  185  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  45.71 
 
 		 644 aa  185  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.75 
 
 		 777 aa  182  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  51.38 
 
 		 184 aa  179  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  42.58 
 
 		 821 aa  177  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  41.86 
 
 		 1095 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  43.37 
 
 		 938 aa  171  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  49.21 
 
 		 816 aa  170  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  32.87 
 
 		 929 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  41.47 
 
 		 1189 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  34.73 
 
 		 1987 aa  162  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30.36 
 
 		 734 aa  160  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  39.08 
 
 		 848 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  45.29 
 
 		 500 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  32.43 
 
 		 684 aa  152  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  31.83 
 
 		 1380 aa  152  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  46.67 
 
 		 1231 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  31.88 
 
 		 1371 aa  147  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  43.48 
 
 		 400 aa  147  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  45.23 
 
 		 1328 aa  145  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  43.17 
 
 		 996 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  24.93 
 
 		 1466 aa  142  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  38.96 
 
 		 408 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>