183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1417 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  100 
 
 
133 aa  266  8e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  66.92 
 
 
133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  63.16 
 
 
135 aa  180  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  59.23 
 
 
133 aa  168  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  54.96 
 
 
143 aa  148  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  54.2 
 
 
135 aa  140  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  44.53 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  40 
 
 
129 aa  111  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  39.84 
 
 
130 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  40.46 
 
 
131 aa  108  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.4 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2245  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.59 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.177211  hitchhiker  0.00554027 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.06 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0696  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.45 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.63 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.37 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.08 
 
 
291 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.08 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.95 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.78 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.95 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.29 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.12 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2113  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.25 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.716439  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  28.68 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.68 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2727  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.13 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2405  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.91 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0914796  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2172  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.15 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.130516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  32.82 
 
 
289 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0820  CbiX  25.98 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  32.03 
 
 
253 aa  58.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.4 
 
 
247 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.36 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2810  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.93 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0938  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.03 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.56 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.94 
 
 
299 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  26.77 
 
 
236 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.73 
 
 
330 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0981  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.12 
 
 
301 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  26.56 
 
 
259 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  26.77 
 
 
236 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1172  CbiX  28.35 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0919733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  26.77 
 
 
236 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3731  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.27 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000108177  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1918  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.05 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1012  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  28.35 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1019  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  28.35 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0568  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.11 
 
 
314 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2474  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.14 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1858  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.14 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2469  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.14 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.65 
 
 
253 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1945  hypothetical protein  27.38 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.982544  normal  0.0685142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  27.56 
 
 
236 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2222  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.62 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.910475  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0669  cbiX protein  27.56 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5800  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.95 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2682  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.62 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2342  cbiX protein  27.56 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2943  cbiX protein  27.56 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1656  cbiX protein  27.56 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2418  hypothetical protein  23.81 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  26.77 
 
 
236 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  29.41 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  26.77 
 
 
236 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 
263 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.72 
 
 
125 aa  52  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000175359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.44 
 
 
242 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  25.98 
 
 
236 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.29 
 
 
247 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2708  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.03 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.98 
 
 
236 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  25.98 
 
 
236 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  34.52 
 
 
337 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1231  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.37 
 
 
238 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2518  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.76 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  34.52 
 
 
337 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  26.32 
 
 
379 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3641  hypothetical protein  30.95 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.89 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  26.72 
 
 
375 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2726  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.71 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000062015 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3127  hypothetical protein  27.71 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  28.1 
 
 
251 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  26.32 
 
 
401 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  25.88 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.44 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 
309 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  27.5 
 
 
250 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.46 
 
 
307 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.69 
 
 
298 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.43 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2386  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.76 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3493  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.82 
 
 
245 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>