More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1388 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 393 aa  791    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  53.91 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  50 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  47.95 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  43.37 
 
 		 391 aa  334  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.07 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.35 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  31.39 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  26.99 
 
 		 419 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  28.11 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 		 398 aa  121  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.64 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  29.37 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  27.69 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  28.13 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.7 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  31.2 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  31.87 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  28.64 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.29 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.86 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  27.93 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  29.87 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  27.9 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  28.73 
 
 		 386 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.23 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  27.76 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  27.67 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  32.87 
 
 		 385 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.46 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.95 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.6 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  28.47 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  27.94 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  26.53 
 
 		 435 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  29.7 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.89 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.16 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  28.9 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  29.31 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  28.04 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  31.53 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  30.77 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  26.74 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  28.28 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  27.31 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  27.92 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.68 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  26.77 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  27.82 
 
 		 434 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  26.91 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  27.98 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  27.4 
 
 		 452 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  27.06 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.48 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  31.89 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  24.77 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  28.37 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  26.39 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  28.68 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  29.3 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.18 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.45 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.81 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  24.74 
 
 		 510 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.12 
 
 		 365 aa  100  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  26.13 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  27.41 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  27.41 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  26.79 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  26.9 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  25.37 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  25.39 
 
 		 507 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  27.7 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  25.39 
 
 		 507 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.7 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.54 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 		 432 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  26.4 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  25.19 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  27.65 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.3 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  26.18 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  27.09 
 
 		 387 aa  96.3  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  24.55 
 
 		 384 aa  96.3  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  28.81 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3179  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.56 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  29.08 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  27.21 
 
 		 441 aa  95.5  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  34.8 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>