51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1299 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  487  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  54.24 
 
 		 236 aa  271  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  52.97 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.57 
 
 		 243 aa  247  9e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  53.45 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  36.56 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  37.92 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  38.96 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  33.06 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  31.16 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  34.76 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  35.55 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  33.86 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  30.98 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.84 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  32.18 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  28.85 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  29.74 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  29.74 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  28.79 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  29.62 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.29 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  32.74 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.14 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.46 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.09 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.79 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.41 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  28.71 
 
 		 277 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  26.18 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.89 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  25.36 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  28.5 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  28.74 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.35 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.74 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  24.68 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  28.24 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.31 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  27.95 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.7 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.53 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  31.15 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  27.12 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  32.91 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  31.48 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.93 
 
 		 257 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.37 
 
 		 249 aa  41.6  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>