More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1206 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  53.59 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  49.4 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  55.22 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  48.08 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  40.71 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  42.96 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.14 
 
 		 243 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  40.26 
 
 		 282 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  35.71 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  37.97 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  37.27 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  33.89 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  34.62 
 
 		 225 aa  99.4  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 191 aa  98.6  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  33.53 
 
 		 206 aa  97.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.26 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  38.1 
 
 		 211 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32.78 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.33 
 
 		 200 aa  95.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  38.06 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  36.09 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  40 
 
 		 213 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  37.32 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  35.62 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  34.94 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  36.88 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.84 
 
 		 207 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  38.41 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 		 210 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  40 
 
 		 208 aa  92  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  39.72 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 203 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  35.39 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  36.62 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 175 aa  91.3  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  36.62 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  37.68 
 
 		 172 aa  91.3  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 		 210 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 259 aa  90.9  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 230 aa  90.9  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  37.24 
 
 		 230 aa  90.9  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.68 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  38.06 
 
 		 244 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  35.34 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 203 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 259 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.76 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  29.79 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.15 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  36.57 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 206 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 206 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  35.43 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  37.24 
 
 		 239 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 		 228 aa  88.6  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 206 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  36.84 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  36.02 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 206 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.21 
 
 		 204 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  37.68 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  36.84 
 
 		 226 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.76 
 
 		 208 aa  88.2  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  34.31 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 186 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  37.41 
 
 		 213 aa  87.8  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 239 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  37.41 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  36.42 
 
 		 234 aa  87  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  36.3 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  31.79 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  34.33 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  34.85 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  35.17 
 
 		 247 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  34.18 
 
 		 240 aa  86.3  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  36.67 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  33.52 
 
 		 247 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  30.29 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.17 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  37.12 
 
 		 242 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  36 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  38.78 
 
 		 203 aa  85.1  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  30.32 
 
 		 199 aa  85.1  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  35.06 
 
 		 188 aa  85.1  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  33.72 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.36 
 
 		 210 aa  85.1  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  35.86 
 
 		 239 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  33.33 
 
 		 162 aa  85.1  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  37.59 
 
 		 224 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.15 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  36.24 
 
 		 202 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  34.97 
 
 		 194 aa  84.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.57 
 
 		 202 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>