36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1192 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  713    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  60 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  31.31 
 
 		 342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  31.31 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  31.43 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  31.07 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  29.01 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  32.3 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  29.97 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  27.78 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  32.42 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  27.7 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  29.33 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  31.16 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  28.29 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  26.75 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  23.84 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  26.47 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  23.94 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  23.96 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  27.11 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.01 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  20.72 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  24.1 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.93 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  24.82 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.51 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.13 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  21.96 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  21.96 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.64 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  25.27 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.19 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  25.7 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.45 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.13 
 
 		 337 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>