228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1159 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
121 aa  244  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  43.93 
 
 
111 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  42.11 
 
 
110 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  41 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  39.25 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  42.59 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  35.9 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.27 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  42.05 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.19 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.74 
 
 
437 aa  71.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  34.51 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  33.65 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 
436 aa  67  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  31.93 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  37.78 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  30.09 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.89 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  30.61 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  30.17 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  30.63 
 
 
782 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  31.62 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
269 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.82 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 
250 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  28.45 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 
108 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.05 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  31.18 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  33.64 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  27.36 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  23.89 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  32.11 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  27.1 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  28.85 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  28.85 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.73 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.77 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  29.03 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  26.32 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.11 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  28.85 
 
 
183 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.45 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.77 
 
 
112 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  25.64 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  22.03 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>