59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1125 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1125  hydrogenase-4 component E  100 
 
 		 230 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457842  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1820  hypothetical protein  49.07 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000203651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1451  hydrogenase subunit  51.5 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1573  hydrogenase subunit, putative  51 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1319  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  50 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  28.3 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  30.66 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  30.66 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  30.66 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  30.66 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  29.41 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  30.33 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.09 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  28.1 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.56 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  26.77 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  31.29 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  29.44 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  31.29 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.95 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  28.42 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  25.79 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.56 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.73 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  27.69 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  24.6 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  28.57 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.81 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.81 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4572  hydrogenase 4 membrane subunit  29.58 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0931  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.05 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  29.19 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  31.65 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  31.65 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  27.55 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.29 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.1 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28.57 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  28.34 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10086  hydrogenase hycP  23.14 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000096186  normal  0.18173 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.26 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00970  hydrogenase 4 membrane subunit  26.06 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1995  conserved hypothetical protein  23.96 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.829776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1140  hydrogenase subunit  24.11 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0730  hydrogenase subunit  24.88 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0129986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  26.32 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  23.72 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1039  hydrogenase 4 membrane subunit  29.23 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000344071  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1282  hydrogenase 4 membrane subunit  27.8 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.077695  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  23.93 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2711  hydrogenase 4 membrane subunit  26.34 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2151  hydrogenase-4, E subunit  26.42 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1809  hydrogenase 4 membrane component  26.42 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1912  hydrogenase 4 membrane subunit  27.78 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199181  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1433  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  23.04 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.758709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>