More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1124 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  100 
 
 
494 aa  958    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  46.55 
 
 
460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  45.91 
 
 
499 aa  398  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  48.29 
 
 
493 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  46.04 
 
 
489 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  32.75 
 
 
486 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  31.59 
 
 
487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.65 
 
 
495 aa  220  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  32.05 
 
 
483 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  33.43 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  31.04 
 
 
484 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  30.71 
 
 
488 aa  210  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  31.03 
 
 
484 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  32.29 
 
 
486 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  32.44 
 
 
483 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  32.3 
 
 
486 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  32.3 
 
 
486 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  32.3 
 
 
486 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  31.7 
 
 
483 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  33.51 
 
 
484 aa  203  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  33.51 
 
 
484 aa  203  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  32.08 
 
 
463 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  30.87 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  32.23 
 
 
512 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  30.56 
 
 
481 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  31.88 
 
 
482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  33.42 
 
 
526 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  33.16 
 
 
521 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  33.82 
 
 
526 aa  193  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  33.82 
 
 
526 aa  193  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  33.82 
 
 
526 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  33.82 
 
 
526 aa  193  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  32.48 
 
 
495 aa  193  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  33.82 
 
 
526 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  30.8 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
484 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.98 
 
 
489 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  33.53 
 
 
517 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  33.24 
 
 
538 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  31.57 
 
 
553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.56 
 
 
489 aa  179  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  34.27 
 
 
499 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 
506 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 
493 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  31.13 
 
 
491 aa  173  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  33.43 
 
 
483 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  33.43 
 
 
483 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  37.17 
 
 
512 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 
428 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.71 
 
 
477 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.58 
 
 
477 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  28.83 
 
 
493 aa  169  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  28.71 
 
 
491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  32.06 
 
 
488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  30.66 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  30.66 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.5 
 
 
492 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  30.24 
 
 
531 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.07 
 
 
533 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  28.13 
 
 
491 aa  162  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  30.39 
 
 
476 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.1 
 
 
537 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.91 
 
 
448 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
500 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  29.68 
 
 
477 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  28.78 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  30.97 
 
 
477 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.93 
 
 
478 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.23 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  30.4 
 
 
479 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  29.18 
 
 
497 aa  143  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.99 
 
 
472 aa  143  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  29.5 
 
 
477 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0564  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.59 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.28 
 
 
538 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.2 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.99 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.78 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  29.77 
 
 
1264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.97 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.84 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  28.57 
 
 
506 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  26.14 
 
 
478 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.41 
 
 
542 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  28.48 
 
 
534 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.51 
 
 
499 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.46 
 
 
688 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  29.18 
 
 
560 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30 
 
 
502 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.67 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  29.18 
 
 
560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.57 
 
 
544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  29.44 
 
 
643 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1620  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.97 
 
 
503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.78 
 
 
504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40907  hitchhiker  0.000181447 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0763  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.23 
 
 
492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1280  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.45 
 
 
554 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0511  NADH ubiquinone/plastoquinone complex subunit, putative  28.05 
 
 
488 aa  126  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>