More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1081 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  82.4 
 
 		 130 aa  215  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  56.12 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 126 aa  121  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  47.32 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  52.53 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  46.85 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  46.85 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  46.85 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  46.85 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  46.85 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  46.85 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  46.49 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  51.52 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  52.13 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  49.47 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  51.55 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  43.7 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  53.54 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  47.96 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  46.94 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  49.49 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.51 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  48.45 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  46.32 
 
 		 114 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  47.47 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  47.47 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  48.48 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  45.36 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  45.28 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  48.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  48.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  48.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  48.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  48.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  48.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  48.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  46.39 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  49.02 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  48.91 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  48.91 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  48.91 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  50.56 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  48.04 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  48.04 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  48.04 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  49.02 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  47.52 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>