More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1025 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  100 
 
 
223 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  81.9 
 
 
232 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  62.27 
 
 
224 aa  304  6e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  65.61 
 
 
234 aa  299  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  58.45 
 
 
228 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  60 
 
 
223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  60.91 
 
 
228 aa  280  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  56.82 
 
 
226 aa  271  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  57.47 
 
 
222 aa  271  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  56.16 
 
 
226 aa  268  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  56.88 
 
 
227 aa  263  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  56.62 
 
 
226 aa  262  4e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  50.9 
 
 
225 aa  247  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 
228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  50.45 
 
 
234 aa  228  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
246 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
248 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.95 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50.23 
 
 
225 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.55 
 
 
242 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 
240 aa  218  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  48.87 
 
 
229 aa  218  7e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.49 
 
 
225 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  47.73 
 
 
248 aa  217  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  46.85 
 
 
264 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.89 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.51 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  50.71 
 
 
241 aa  215  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.86 
 
 
266 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.61 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.56 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  48.88 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  47.49 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.4 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  45.25 
 
 
642 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.21 
 
 
239 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.05 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
240 aa  211  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.44 
 
 
242 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  43.64 
 
 
244 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.86 
 
 
230 aa  210  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.95 
 
 
230 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.09 
 
 
230 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  48.62 
 
 
228 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
222 aa  209  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.64 
 
 
234 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.98 
 
 
244 aa  209  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
232 aa  209  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.67 
 
 
234 aa  208  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.67 
 
 
234 aa  208  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.25 
 
 
241 aa  208  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  46.36 
 
 
653 aa  208  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 
233 aa  208  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.3 
 
 
233 aa  207  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  47.3 
 
 
291 aa  207  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 
241 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  46.85 
 
 
236 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  45.29 
 
 
656 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  45.54 
 
 
642 aa  207  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  47.73 
 
 
241 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  45.81 
 
 
234 aa  206  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 
241 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
252 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  45.98 
 
 
249 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  45.37 
 
 
238 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.58 
 
 
232 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.02 
 
 
239 aa  205  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
228 aa  205  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.44 
 
 
237 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  47.69 
 
 
247 aa  205  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.69 
 
 
653 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.64 
 
 
234 aa  204  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 
408 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  45.09 
 
 
653 aa  204  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  47.56 
 
 
228 aa  204  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1518  ABC transporter related  50 
 
 
222 aa  203  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.09 
 
 
228 aa  203  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  45.09 
 
 
224 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  48.62 
 
 
230 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 
237 aa  203  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
252 aa  202  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  47.77 
 
 
247 aa  203  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  47.98 
 
 
237 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  47.03 
 
 
249 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  43.75 
 
 
234 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  45.18 
 
 
233 aa  202  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.05 
 
 
235 aa  202  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.69 
 
 
231 aa  202  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  45.37 
 
 
253 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
227 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.74 
 
 
238 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  45.5 
 
 
239 aa  201  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  45.66 
 
 
230 aa  201  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  45.21 
 
 
233 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  44.14 
 
 
252 aa  201  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  46.22 
 
 
228 aa  201  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  47.56 
 
 
241 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  46.15 
 
 
224 aa  201  8e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>