More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1014 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  70.37 
 
 		 190 aa  291  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  48.66 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  48.66 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  48.66 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  48.66 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  48.66 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  48.66 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  48.66 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  48.66 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  47.34 
 
 		 198 aa  176  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  47.06 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  50.53 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  48.95 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  44.92 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  44.92 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  44.92 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  44.92 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  44.92 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  46.28 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  46.11 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  42.33 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  41.58 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  41.8 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  45.9 
 
 		 190 aa  151  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  43.24 
 
 		 189 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  41.97 
 
 		 200 aa  140  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  43.89 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  41.27 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  43.89 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  43.33 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  41.81 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  39.55 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  38.5 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  38.5 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  43.18 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 239 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 239 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  45.83 
 
 		 227 aa  84.7  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  44.79 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  36.94 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  42.71 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  40.62 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  29.28 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  31.06 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  37.84 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  31.18 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  31.18 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  26.92 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  30.81 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  30.81 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  28.88 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  42.71 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  39.58 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  30.6 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  28.78 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 213 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  27.36 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>