65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0988 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  522  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  47.66 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  38.72 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.99 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  36.28 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  38.96 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  29.44 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  37.26 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  34.31 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  30.8 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  30.34 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  29.33 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  26.96 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  27.76 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  29.48 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.15 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  29.49 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.15 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  32.16 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.35 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  29.1 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  30.21 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  28.64 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  30.61 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  26.06 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.52 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  28.72 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.66 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  29.02 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  28.11 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  24.73 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  28.49 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  27.68 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  26.57 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.41 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  27.27 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10684  endonuclease IV  26.5 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0188886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  26.5 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  26.86 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.49 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  27.44 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.47 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3304  xylose isomerase domain-containing protein  25.76 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.7 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  25.76 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  28.12 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  23.33 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  24.09 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.18 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0325  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.19 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1000  endonuclease IV  26 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0990  endonuclease IV  26 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238948  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0972  endonuclease IV  26 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  27.47 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2094  xylose isomerase domain-containing protein  27.93 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.27 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.09 
 
 		 261 aa  42  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>