More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0983 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  100 
 
 
351 aa  710    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  51.46 
 
 
331 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  49.84 
 
 
354 aa  300  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  46.18 
 
 
321 aa  292  5e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  43.6 
 
 
335 aa  278  9e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  45.32 
 
 
307 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  41.49 
 
 
338 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  41.49 
 
 
338 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  41.84 
 
 
337 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  41.49 
 
 
338 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  37.01 
 
 
363 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  36.91 
 
 
318 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  38.49 
 
 
315 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  38.49 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  38.1 
 
 
341 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  35.62 
 
 
318 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  34.19 
 
 
309 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  34.44 
 
 
300 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  39.93 
 
 
356 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  35.32 
 
 
318 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  39.19 
 
 
517 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  34.95 
 
 
318 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  35.17 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  34.64 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  30.69 
 
 
296 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  34.57 
 
 
287 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  34.19 
 
 
328 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  33.57 
 
 
318 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  34.89 
 
 
300 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  32.89 
 
 
300 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  30.28 
 
 
339 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  36.26 
 
 
304 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.99 
 
 
313 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  31.91 
 
 
300 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  32.89 
 
 
379 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  31.86 
 
 
300 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.67 
 
 
309 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.18 
 
 
275 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  30.22 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  31.45 
 
 
300 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  32.85 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3496  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  32.22 
 
 
303 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.590547  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  31.87 
 
 
288 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  29.8 
 
 
274 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  30.25 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  28.27 
 
 
297 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.2 
 
 
254 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  28.27 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.54 
 
 
287 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  30.15 
 
 
294 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  30.86 
 
 
275 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  31.05 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  29.5 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  29.07 
 
 
274 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  31.56 
 
 
275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  30.86 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  28.26 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  31.75 
 
 
310 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  31.75 
 
 
332 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  27.7 
 
 
317 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.75 
 
 
310 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.75 
 
 
310 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0844  periplasmic binding protein  31.25 
 
 
305 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.75 
 
 
310 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.75 
 
 
310 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  31.05 
 
 
339 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  30.45 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.39 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  33.91 
 
 
310 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0962  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
285 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  32.38 
 
 
289 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  27.41 
 
 
300 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  30.04 
 
 
275 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  28.02 
 
 
294 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  28.43 
 
 
305 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  30.27 
 
 
304 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2366  periplasmic binding protein  31.25 
 
 
308 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  30.18 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1492  periplasmic binding protein  28.68 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.285572  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  30.49 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1178  vitamin B12-transporter protein BtuF  28.25 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  30.27 
 
 
304 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  34.43 
 
 
271 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  26.76 
 
 
322 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2455  periplasmic binding protein  29.6 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1839  periplasmic binding protein  29.6 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2450  periplasmic binding protein  29.6 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.962038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  28.53 
 
 
305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  30.04 
 
 
292 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  28.78 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
311 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2498  periplasmic binding protein  30.63 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0311  periplasmic binding protein  30.51 
 
 
304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3099  vitamin B12-transporter protein BtuF  27.31 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  28.57 
 
 
295 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01625  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.79 
 
 
308 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  32.83 
 
 
269 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  29.81 
 
 
276 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>