More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0978 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
317 aa  636    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  42.95 
 
 
331 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  39.72 
 
 
299 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  39.37 
 
 
299 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 
309 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.02 
 
 
299 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 
326 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 
343 aa  202  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  40.86 
 
 
309 aa  202  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  39.87 
 
 
334 aa  202  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.02 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38.33 
 
 
299 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  40.27 
 
 
316 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.98 
 
 
299 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.98 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.98 
 
 
299 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  37.5 
 
 
312 aa  196  3e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.98 
 
 
299 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  40.86 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  40.86 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 
327 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  40.92 
 
 
335 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 
342 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.16 
 
 
295 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  36.42 
 
 
312 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  40.59 
 
 
341 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  39.93 
 
 
298 aa  191  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 
315 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  39.22 
 
 
305 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  38.64 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 
311 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  38.01 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  39.12 
 
 
300 aa  189  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.12 
 
 
300 aa  189  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  40.69 
 
 
314 aa  188  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  39.87 
 
 
312 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.05 
 
 
299 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 
298 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  38.7 
 
 
312 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  38.7 
 
 
312 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 
311 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  38.7 
 
 
312 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  36.7 
 
 
314 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
324 aa  186  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  39.74 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  36.73 
 
 
294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  36.49 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  36.54 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  34.82 
 
 
313 aa  182  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  38.21 
 
 
317 aa  182  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 
342 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  36.69 
 
 
317 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  42.27 
 
 
300 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  36.24 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
304 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 
320 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 
305 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  35.02 
 
 
316 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  41.38 
 
 
299 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  33.87 
 
 
327 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 
309 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  37.54 
 
 
312 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  37.22 
 
 
312 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  37.46 
 
 
315 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 
304 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  37.22 
 
 
312 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  37.22 
 
 
312 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  37.22 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  39.79 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 
284 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 
302 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.96 
 
 
304 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 
342 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  38.27 
 
 
299 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 
284 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  34.95 
 
 
294 aa  170  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 
300 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 
329 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 
323 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  34.02 
 
 
300 aa  169  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  39.07 
 
 
316 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  36.33 
 
 
378 aa  169  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  34.45 
 
 
307 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 
342 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  38.33 
 
 
299 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 
321 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 
321 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  37.75 
 
 
316 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>