More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0818 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  100 
 
 
530 aa  1016    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  53.15 
 
 
528 aa  508  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  49.88 
 
 
1356 aa  389  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  46.84 
 
 
1842 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  46.71 
 
 
735 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  46.33 
 
 
1094 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  48.81 
 
 
752 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  48.45 
 
 
1862 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  42.18 
 
 
1282 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  47.52 
 
 
1882 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  48.01 
 
 
561 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  47.28 
 
 
2036 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  45.57 
 
 
1361 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  44.69 
 
 
978 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  45.92 
 
 
2272 aa  362  6e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  49.41 
 
 
963 aa  362  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  45.69 
 
 
575 aa  361  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  45.58 
 
 
1682 aa  361  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  46.06 
 
 
2122 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  45.73 
 
 
1667 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  47.4 
 
 
2554 aa  354  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  44.83 
 
 
2000 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  46.9 
 
 
1236 aa  326  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  42.63 
 
 
838 aa  323  5e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  50 
 
 
859 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  41.27 
 
 
941 aa  319  7e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  53.42 
 
 
460 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  50 
 
 
1241 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  45.53 
 
 
675 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  44.93 
 
 
713 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  46.49 
 
 
679 aa  309  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  47.95 
 
 
685 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  48.34 
 
 
669 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  48.5 
 
 
1300 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  43.61 
 
 
958 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  39.21 
 
 
1732 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  48.81 
 
 
1969 aa  302  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  46.65 
 
 
930 aa  297  4e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  47.37 
 
 
1120 aa  296  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  47.45 
 
 
658 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  44.27 
 
 
1667 aa  280  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  36.93 
 
 
1528 aa  267  5e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  52.67 
 
 
910 aa  266  7e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  44.5 
 
 
1387 aa  263  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  41.41 
 
 
1783 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.87 
 
 
861 aa  257  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  52.23 
 
 
547 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  53.97 
 
 
3295 aa  250  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  51 
 
 
581 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  51.21 
 
 
791 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  47.62 
 
 
615 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  48.79 
 
 
551 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.61 
 
 
971 aa  230  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.31 
 
 
869 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  37.41 
 
 
2176 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.18 
 
 
823 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  37.74 
 
 
1814 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.64 
 
 
870 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  36.89 
 
 
1011 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.3 
 
 
719 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  38.08 
 
 
840 aa  203  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  42.61 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.87 
 
 
845 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  48.37 
 
 
2552 aa  196  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  46.83 
 
 
802 aa  194  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  36.58 
 
 
1292 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  44.53 
 
 
786 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  47.58 
 
 
819 aa  189  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  47.22 
 
 
777 aa  189  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.72 
 
 
439 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  45.56 
 
 
930 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  44.06 
 
 
1095 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  31.29 
 
 
865 aa  176  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  56.79 
 
 
184 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  30.33 
 
 
952 aa  170  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  35.1 
 
 
1531 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  33.71 
 
 
929 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.37 
 
 
1606 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  34.88 
 
 
1602 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  50 
 
 
560 aa  163  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  47.98 
 
 
644 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  42.8 
 
 
938 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  47.87 
 
 
519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  32.7 
 
 
1620 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  40.61 
 
 
821 aa  154  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  33.11 
 
 
1987 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  36.76 
 
 
1189 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  33.13 
 
 
1380 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  45.96 
 
 
996 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  42.13 
 
 
848 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  45.88 
 
 
1931 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  45.09 
 
 
500 aa  143  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  38.1 
 
 
408 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  44.64 
 
 
816 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30 
 
 
734 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  43.58 
 
 
1328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  46.71 
 
 
940 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  34.25 
 
 
1565 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  43.75 
 
 
819 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  42.69 
 
 
1231 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>