More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0735 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  60.98 
 
 
253 aa  329  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  63.79 
 
 
263 aa  323  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  59.84 
 
 
252 aa  322  4e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  60.83 
 
 
260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  59.35 
 
 
251 aa  305  7e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  62.07 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  56.91 
 
 
252 aa  300  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  57.5 
 
 
246 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  50.2 
 
 
258 aa  284  7e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  53.31 
 
 
256 aa  280  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  50.81 
 
 
254 aa  279  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.4 
 
 
288 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48.24 
 
 
263 aa  274  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.02 
 
 
258 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.2 
 
 
254 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50.81 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50.2 
 
 
254 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  51.63 
 
 
306 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.38 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  51.26 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  50 
 
 
272 aa  265  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
272 aa  265  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
272 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  52.4 
 
 
274 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  49.19 
 
 
259 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51 
 
 
264 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  47.58 
 
 
257 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
308 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  55.11 
 
 
307 aa  262  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51.01 
 
 
292 aa  261  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  52.03 
 
 
273 aa  261  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  52.54 
 
 
297 aa  260  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  49.21 
 
 
273 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
261 aa  259  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.81 
 
 
261 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  51.48 
 
 
301 aa  258  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  49.19 
 
 
272 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  58.5 
 
 
280 aa  257  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  52.36 
 
 
274 aa  257  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  47.15 
 
 
267 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  48.75 
 
 
265 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  51.75 
 
 
304 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  49.79 
 
 
304 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  49.2 
 
 
259 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48 
 
 
261 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  48.37 
 
 
267 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.6 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.4 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.32 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.81 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.02 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  48.8 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  51.77 
 
 
303 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  51.77 
 
 
303 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  51.77 
 
 
303 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  50.6 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  47.98 
 
 
258 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
278 aa  251  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.59 
 
 
260 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  49.17 
 
 
249 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
264 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  48.21 
 
 
282 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  49.21 
 
 
264 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50.88 
 
 
284 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.96 
 
 
271 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.13 
 
 
289 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50.88 
 
 
260 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 
271 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 
271 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49.15 
 
 
269 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.77 
 
 
263 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
267 aa  248  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  51.71 
 
 
286 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  48.59 
 
 
267 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.95 
 
 
272 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.26 
 
 
279 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  49.37 
 
 
272 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  51.5 
 
 
286 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  49.34 
 
 
303 aa  245  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  51.08 
 
 
291 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  47.77 
 
 
269 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.37 
 
 
259 aa  245  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.72 
 
 
287 aa  244  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  51.54 
 
 
279 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  49.34 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  49.34 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.3 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  50.86 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.81 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  47.6 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.4 
 
 
278 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 
278 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.39 
 
 
259 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  47.74 
 
 
267 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  46.92 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  47.56 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>