More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0683 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  83 
 
 
401 aa  690    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  77.61 
 
 
402 aa  638    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  100 
 
 
401 aa  817    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  80.2 
 
 
399 aa  657    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  80.05 
 
 
401 aa  662    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  64.84 
 
 
405 aa  544  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  58.1 
 
 
404 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  58.35 
 
 
404 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  58.35 
 
 
403 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  57.61 
 
 
404 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  55.11 
 
 
404 aa  436  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  52.35 
 
 
423 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  52.48 
 
 
419 aa  393  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  51.72 
 
 
427 aa  393  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  51.98 
 
 
422 aa  385  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  51.5 
 
 
459 aa  360  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  45.78 
 
 
432 aa  326  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  46.67 
 
 
394 aa  326  3e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  51.43 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  51.14 
 
 
348 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  51.92 
 
 
348 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  50.73 
 
 
349 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  46.13 
 
 
354 aa  316  6e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  49.34 
 
 
396 aa  315  8e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  46.97 
 
 
351 aa  315  9e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  49.14 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  44.47 
 
 
391 aa  311  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  45.83 
 
 
351 aa  310  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  50.86 
 
 
346 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  49.43 
 
 
346 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  45.06 
 
 
408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  49.34 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  48.79 
 
 
368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  48.81 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  46.99 
 
 
346 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  45.41 
 
 
363 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  47.19 
 
 
371 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  50 
 
 
351 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  47.73 
 
 
356 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2453  threonine synthase  47.14 
 
 
360 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351882  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  46.57 
 
 
368 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  48.31 
 
 
352 aa  296  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  46.24 
 
 
362 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  51.67 
 
 
360 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  51.67 
 
 
360 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  51.67 
 
 
360 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  45.95 
 
 
363 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  46.57 
 
 
368 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  48.38 
 
 
351 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  46.7 
 
 
367 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  47.79 
 
 
353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  42.75 
 
 
414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  47.79 
 
 
353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  45.48 
 
 
345 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  50.15 
 
 
366 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  49.56 
 
 
339 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  46.2 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  48.54 
 
 
348 aa  286  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0596  threonine synthase  44.62 
 
 
380 aa  286  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  47.98 
 
 
354 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  46.99 
 
 
367 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  48.94 
 
 
359 aa  285  8e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  48.84 
 
 
348 aa  285  9e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  44.16 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  44.16 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  46.42 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  47.56 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  46.31 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  47.49 
 
 
361 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  48.94 
 
 
360 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  45 
 
 
352 aa  283  5.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  48.94 
 
 
359 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1241  threonine synthase  46.8 
 
 
344 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000161931  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  49.54 
 
 
331 aa  282  8.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  48.94 
 
 
366 aa  282  9e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  46.13 
 
 
367 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  46.98 
 
 
377 aa  279  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1440  threonine synthase  43.4 
 
 
379 aa  279  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  46.47 
 
 
354 aa  279  7e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0631  threonine synthase  48.71 
 
 
365 aa  279  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  hitchhiker  0.00263749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  46.26 
 
 
357 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30231  threonine synthase  46.15 
 
 
352 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  47.69 
 
 
352 aa  276  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  48.04 
 
 
353 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1395  threonine synthase  44.59 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  48.05 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  45.15 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  47.69 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  49.54 
 
 
353 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  45.22 
 
 
352 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  46.53 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  40.53 
 
 
483 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  47.77 
 
 
370 aa  269  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  44.05 
 
 
368 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  45.2 
 
 
356 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  46.97 
 
 
349 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2355  threonine synthase  43.78 
 
 
368 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000649768 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  46.65 
 
 
352 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1821  threonine synthase  42.97 
 
 
378 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.540438  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  45.94 
 
 
353 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.209193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>